More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  100 
 
 		 439 aa  870    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  83.12 
 
 		 408 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3018  inner-membrane translocator  67.45 
 
 		 390 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3064  inner-membrane translocator  67.45 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3033  inner-membrane translocator  67.19 
 
 		 390 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235152  normal  0.243359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2843  inner-membrane translocator  64.4 
 
 		 391 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3572  inner-membrane translocator  64.4 
 
 		 381 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0134037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  46.02 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  46.02 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3148  inner-membrane translocator  44.7 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.178722  normal  0.58518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  44.42 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  44.14 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2857  inner-membrane translocator  42.35 
 
 		 393 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  41.19 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  42.18 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.66 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.66 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.66 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.66 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.66 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.66 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.66 
 
 		 389 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.5 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.09 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 454 aa  226  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  42.53 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  45.4 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  41.83 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  40 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.39 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  43.86 
 
 		 463 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  42.27 
 
 		 327 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  40.11 
 
 		 454 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.96 
 
 		 418 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  41.32 
 
 		 321 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  43.26 
 
 		 363 aa  216  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  42.51 
 
 		 384 aa  216  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  40.92 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  42.02 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  41.31 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 358 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  40.18 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.95 
 
 		 423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6113  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 389 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  41.01 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  41.09 
 
 		 375 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  41.09 
 
 		 375 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.83 
 
 		 412 aa  209  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.1 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  41.83 
 
 		 359 aa  206  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 415 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.48 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2039  inner-membrane translocator  46.77 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  41.29 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.57 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2727  inner-membrane translocator  40.87 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.01 
 
 		 418 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.57 
 
 		 421 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.63 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.63 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.63 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50540  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.85 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0377625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40.55 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 452 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 363 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.2 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.2 
 
 		 418 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.2 
 
 		 418 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.2 
 
 		 418 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1861  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  40.19 
 
 		 368 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0760  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000323795 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.04 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3004  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 583 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2550  inner-membrane translocator  45.25 
 
 		 370 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40.57 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.04 
 
 		 423 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40.57 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  40 
 
 		 463 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.04 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2250  inner-membrane translocator  38.42 
 
 		 464 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571474  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.72 
 
 		 423 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.72 
 
 		 423 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.72 
 
 		 423 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>