More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3004 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3004  inner-membrane translocator  100 
 
 		 583 aa  1123    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940026  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  47.24 
 
 		 398 aa  323  8e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2030  inner-membrane translocator  44.84 
 
 		 385 aa  287  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.710077  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  38.39 
 
 		 454 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 384 aa  240  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 389 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 358 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  41.09 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  41.09 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  41.46 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  41.09 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.62 
 
 		 389 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.22 
 
 		 389 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  41.02 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 389 aa  236  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.5 
 
 		 389 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.5 
 
 		 389 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.5 
 
 		 389 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.5 
 
 		 389 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  42.25 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.5 
 
 		 389 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  43.66 
 
 		 373 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.5 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.5 
 
 		 389 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 389 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  41.13 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  43.02 
 
 		 378 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 389 aa  230  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  41.19 
 
 		 358 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 454 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 358 aa  227  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.85 
 
 		 389 aa  227  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2727  inner-membrane translocator  42.62 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  42.74 
 
 		 375 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  42.74 
 
 		 375 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 359 aa  224  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 358 aa  224  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  42.05 
 
 		 376 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 398 aa  223  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  43.99 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 363 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6113  inner-membrane translocator  41.78 
 
 		 389 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  43.07 
 
 		 385 aa  218  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 372 aa  217  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  40.46 
 
 		 363 aa  217  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1861  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 449 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 463 aa  213  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  40.85 
 
 		 660 aa  213  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  40.18 
 
 		 389 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 443 aa  210  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  42.48 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  37.89 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 460 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  39.26 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 407 aa  206  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3795  inner-membrane translocator  41.28 
 
 		 361 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0760  inner-membrane translocator  42.69 
 
 		 361 aa  205  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000323795 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  36.8 
 
 		 407 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3207  inner-membrane translocator  39.83 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2857  inner-membrane translocator  43.11 
 
 		 393 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  38.65 
 
 		 463 aa  204  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 408 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 463 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  37.96 
 
 		 477 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.14 
 
 		 421 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.57 
 
 		 421 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 		 459 aa  200  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 459 aa  199  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.38 
 
 		 418 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.24 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.94 
 
 		 418 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  40.12 
 
 		 327 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.94 
 
 		 418 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.94 
 
 		 418 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1746  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 474 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 470 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.86 
 
 		 423 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 386 aa  194  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2652  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 477 aa  194  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000103128  hitchhiker  0.00512558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  38.12 
 
 		 456 aa  193  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.5 
 
 		 412 aa  193  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.43 
 
 		 423 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2396  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00825655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.19 
 
 		 423 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2843  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 391 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.44 
 
 		 428 aa  190  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.44 
 
 		 428 aa  190  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  37.61 
 
 		 321 aa  190  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2250  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571474  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.39 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3324  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0986477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5436  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.01 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0554  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 433 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0237898  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 452 aa  189  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>