More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1760 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1760  inner-membrane translocator  100 
 
 		 361 aa  708    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0155295  hitchhiker  0.000793372 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0590  inner-membrane translocator  73.96 
 
 		 363 aa  532  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.293157  hitchhiker  0.0000778251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1581  inner-membrane translocator  70.28 
 
 		 363 aa  521  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0444  inner-membrane translocator  70.4 
 
 		 359 aa  481  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 349 aa  199  9e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0318  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.936924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1803  inner-membrane translocator  33.52 
 
 		 369 aa  162  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1578  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 344 aa  157  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0304091  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1505  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 371 aa  139  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0827  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 373 aa  132  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  38.53 
 
 		 314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 347 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  27.05 
 
 		 504 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  26.55 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  28.15 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  27.57 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0325  inner-membrane translocator  25.27 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  25.27 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  30.62 
 
 		 436 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1276  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 441 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.521519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  28.11 
 
 		 463 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  26.65 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.76 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  24.24 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0858  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 435 aa  97.1  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2097  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 440 aa  96.7  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.877591  normal  0.0148892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 322 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2933  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 356 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 377 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  28.63 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  35.1 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1207  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 541 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0120652  normal  0.236247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  28.02 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  27.51 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1067  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0499919  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1828  inner-membrane translocator  27.79 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  29.21 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 317 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 320 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 454 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3841  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 295 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  27.2 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  27.9 
 
 		 415 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  27.2 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3962  inner-membrane translocator  35.68 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.63 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1517  hypothetical protein  30.28 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845937  normal  0.47549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  26.5 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  26.21 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  27.37 
 
 		 460 aa  90.1  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  27.57 
 
 		 384 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  28.02 
 
 		 407 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3705  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 377 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3928  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  25.65 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  29.74 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  26.36 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4911  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 456 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  25.77 
 
 		 327 aa  87.4  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  26.67 
 
 		 463 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2550  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1471  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0927911  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  27.64 
 
 		 470 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2157  inner-membrane translocator  27.46 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  25.97 
 
 		 463 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  24.59 
 
 		 347 aa  86.3  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.28 
 
 		 459 aa  86.3  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 373 aa  86.3  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  26.09 
 
 		 300 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  26.18 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  26.84 
 
 		 593 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2771  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.176563  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  23.63 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.83 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  26.94 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  25.21 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.18 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  27.1 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3014  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>