More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0590 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0590  inner-membrane translocator  100 
 
 		 363 aa  713    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.293157  hitchhiker  0.0000778251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1581  inner-membrane translocator  71.55 
 
 		 363 aa  553  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1760  inner-membrane translocator  73.96 
 
 		 361 aa  513  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0155295  hitchhiker  0.000793372 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0444  inner-membrane translocator  71.14 
 
 		 359 aa  492  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0318  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.936924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  43.4 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1803  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1578  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0304091  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1505  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0827  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  37.44 
 
 		 314 aa  129  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  27.48 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 294 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1276  inner-membrane translocator  29.6 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.521519 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  27.07 
 
 		 504 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 347 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  25.79 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.81 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2097  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.877591  normal  0.0148892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  25.62 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 454 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 352 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  25.07 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1067  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0499919  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  30.86 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  27.42 
 
 		 398 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  28.69 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2426  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  27.25 
 
 		 463 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 352 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  27.07 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  28.41 
 
 		 463 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 456 aa  96.3  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  26.29 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1207  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 541 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0120652  normal  0.236247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0858  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3962  inner-membrane translocator  33.18 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1517  hypothetical protein  29.48 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845937  normal  0.47549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  25.42 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  28.16 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  26.48 
 
 		 358 aa  93.6  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3841  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 353 aa  92.8  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4911  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 460 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 470 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  28.03 
 
 		 463 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3705  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  35.68 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  28.57 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3928  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 446 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  27.72 
 
 		 415 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1572  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.207353  normal  0.412707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1828  inner-membrane translocator  28.79 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2727  inner-membrane translocator  27.01 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2927  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.29 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  24.59 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  24.59 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.94 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  24.59 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0922  inner-membrane translocator  26.84 
 
 		 431 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.636778  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  25.56 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2157  inner-membrane translocator  27.71 
 
 		 443 aa  90.1  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  23.98 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  24.59 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  23.78 
 
 		 389 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  24.25 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  25.8 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  25.27 
 
 		 423 aa  89.7  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2771  inner-membrane translocator  26.75 
 
 		 371 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.176563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 459 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0658  inner-membrane translocator  28.98 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  25.56 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  23.51 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  26.48 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.71 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  25.55 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  26.15 
 
 		 401 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.71 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.71 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>