More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4883 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  100 
 
 		 377 aa  736    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  67.65 
 
 		 377 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0325  inner-membrane translocator  67.65 
 
 		 377 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3705  inner-membrane translocator  60.58 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2771  inner-membrane translocator  60.48 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.176563  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  48.16 
 
 		 359 aa  334  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  62.3 
 
 		 436 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  35.01 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0107  inner-membrane translocator  33.51 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.430419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  43.42 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.06 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3014  inner-membrane translocator  42.58 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.4 
 
 		 423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 435 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 386 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4743  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127702  hitchhiker  0.000000177935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  43.95 
 
 		 329 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64880  putative permease of ABC branched-chain amino acid transporter  30.27 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5636  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.27 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0554  inner-membrane translocator  28.65 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0237898  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  40.96 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  28.76 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1230  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382884 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1276  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.521519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1157  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0991659  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.57 
 
 		 427 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.12 
 
 		 423 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.57 
 
 		 427 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 456 aa  119  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3204  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.28 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4921  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0573712  decreased coverage  0.000000000000182248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1973  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0599  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.93 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4657  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123215  decreased coverage  0.00142103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.04 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.04 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.04 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.77 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.77 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0729  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3201  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  40.49 
 
 		 307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3870  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  27.91 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0658  inner-membrane translocator  45.14 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  29.44 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.53 
 
 		 424 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.49 
 
 		 423 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  43.75 
 
 		 322 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2493  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  28.23 
 
 		 435 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  39.58 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2097  inner-membrane translocator  40.23 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.877591  normal  0.0148892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2204  inner-membrane translocator  43.51 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  26.83 
 
 		 393 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2157  inner-membrane translocator  26.61 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0922  inner-membrane translocator  26.89 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.636778  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  41.62 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  26.98 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3841  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3962  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  26.72 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1572  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.207353  normal  0.412707 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2927  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.26 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3004  inner-membrane translocator  28.54 
 
 		 583 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1861  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4469  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  42.18 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  26.6 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1581  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 363 aa  96.3  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 358 aa  96.3  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 356 aa  96.3  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1035  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.977456  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1160  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.625358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.25 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0590  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.293157  hitchhiker  0.0000778251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0444  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  34.3 
 
 		 321 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 		 307 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 408 aa  92.8  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.84 
 
 		 423 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  27.68 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3928  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  38.78 
 
 		 421 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 297 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>