More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2927 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2927  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 431 aa  828    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0922  inner-membrane translocator  91.88 
 
 		 431 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.636778  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1572  inner-membrane translocator  99.54 
 
 		 431 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.207353  normal  0.412707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1276  inner-membrane translocator  69.72 
 
 		 441 aa  595  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.521519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2157  inner-membrane translocator  72.56 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1517  hypothetical protein  71.1 
 
 		 434 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845937  normal  0.47549 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3928  inner-membrane translocator  63.59 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 314 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0325  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  32.03 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 449 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 504 aa  113  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2097  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.877591  normal  0.0148892 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 339 aa  106  8e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  28.31 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.77 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1207  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 541 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0120652  normal  0.236247 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0590  inner-membrane translocator  27.34 
 
 		 363 aa  97.1  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.293157  hitchhiker  0.0000778251 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.73 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 295 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 347 aa  95.1  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1471  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 353 aa  95.5  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0927911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.38 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.07 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.63 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 326 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 336 aa  94  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 358 aa  93.6  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.96 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 353 aa  93.2  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 327 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0444  inner-membrane translocator  28.61 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  30.89 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  27.21 
 
 		 328 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 454 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 345 aa  90.9  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 329 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 340 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.77 
 
 		 423 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  27.05 
 
 		 349 aa  90.5  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.77 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.11 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.77 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4743  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 433 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127702  hitchhiker  0.000000177935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  32.04 
 
 		 378 aa  89.7  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  29.04 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3324  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 484 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0986477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 320 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.71 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 398 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.03 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3870  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.34 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.71 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2250  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571474  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 443 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0106  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.05 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  29.64 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 		 317 aa  87  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 330 aa  87.4  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 399 aa  87.4  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.77 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 358 aa  87  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 358 aa  87  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 456 aa  86.7  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1872  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.88 
 
 		 427 aa  86.3  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  0.0232173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03305  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  31.62 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0259  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.77 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.3 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3831  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.62 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  25.72 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3764  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.62 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03258  hypothetical protein  31.62 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.77 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4773  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.62 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 358 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.77 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0260  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.62 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3654  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.62 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0858  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0138  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3935  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.62 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3738  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.62 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3866  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.62 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  28.75 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.5 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>