More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2157 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2157  inner-membrane translocator  100 
 
 		 443 aa  865    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1276  inner-membrane translocator  66.51 
 
 		 441 aa  579  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.521519 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1517  hypothetical protein  69.05 
 
 		 434 aa  552  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845937  normal  0.47549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0922  inner-membrane translocator  71.4 
 
 		 431 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.636778  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2927  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  73.49 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1572  inner-membrane translocator  73.01 
 
 		 431 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.207353  normal  0.412707 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3928  inner-membrane translocator  61.41 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 314 aa  197  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  33.81 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 504 aa  116  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 339 aa  109  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 295 aa  99  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2097  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.877591  normal  0.0148892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  28.51 
 
 		 329 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 353 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 358 aa  94.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 294 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 336 aa  94.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  24.66 
 
 		 423 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 454 aa  94  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  29.02 
 
 		 328 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0444  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  27.94 
 
 		 418 aa  93.2  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3705  inner-membrane translocator  28.64 
 
 		 377 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  30 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 399 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 377 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0325  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 377 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 340 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  24.88 
 
 		 349 aa  90.9  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 415 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0590  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 363 aa  90.9  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.293157  hitchhiker  0.0000778251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 358 aa  90.9  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 358 aa  90.5  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 358 aa  90.1  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 		 389 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 		 389 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  25 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  26.88 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 377 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.86 
 
 		 389 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  30.39 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 320 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  25 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 		 421 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 463 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  30.36 
 
 		 378 aa  87  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3795  inner-membrane translocator  30.62 
 
 		 361 aa  87  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 389 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4743  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 433 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127702  hitchhiker  0.000000177935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.53 
 
 		 332 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  27.54 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2771  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.176563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3004  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 583 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3207  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 370 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  30.18 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.19 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3324  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0986477  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  25.08 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  30 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1207  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0120652  normal  0.236247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  27.13 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2933  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3962  inner-membrane translocator  33.16 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1581  inner-membrane translocator  27.21 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  26.5 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.01 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.01 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.01 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6113  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.37 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 		 322 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>