More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1419 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  100 
 
 		 314 aa  607  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  55.27 
 
 		 314 aa  326  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  44.26 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 504 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2157  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 443 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3962  inner-membrane translocator  39.18 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3928  inner-membrane translocator  38.35 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1276  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 441 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.521519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3841  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 449 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1517  hypothetical protein  40.23 
 
 		 434 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845937  normal  0.47549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0922  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.636778  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 389 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 		 389 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 		 389 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 		 389 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 		 389 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 		 389 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 		 389 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 389 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.12 
 
 		 389 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 		 389 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 363 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1572  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 431 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.207353  normal  0.412707 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2927  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.36 
 
 		 431 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 389 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 389 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 389 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 389 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  33.13 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.05 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  37.03 
 
 		 439 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2752  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0658  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4469  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1828  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 454 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.3 
 
 		 418 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2097  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 440 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.877591  normal  0.0148892 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1230  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382884 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  33 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2252  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.92 
 
 		 428 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 373 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 408 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 384 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6113  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 389 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 375 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 375 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.2 
 
 		 428 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  33.33 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.19 
 
 		 418 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.27 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  32.25 
 
 		 378 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 398 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1581  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.94 
 
 		 421 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 347 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 358 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 421 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 470 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.09 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3064  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>