More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0332 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  100 
 
 		 377 aa  737    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0325  inner-membrane translocator  99.73 
 
 		 377 aa  735    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  67.65 
 
 		 377 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3705  inner-membrane translocator  57.45 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2771  inner-membrane translocator  57.49 
 
 		 371 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.176563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  49.1 
 
 		 436 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  48.39 
 
 		 359 aa  327  3e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 393 aa  216  8e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  37.4 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 329 aa  173  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 329 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.58 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.87 
 
 		 418 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.25 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.25 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.25 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 443 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 452 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0107  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.430419  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2097  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.877591  normal  0.0148892 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  40.94 
 
 		 328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.73 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.52 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3014  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.06 
 
 		 423 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.06 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.78 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.06 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.06 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0922  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.636778  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.61 
 
 		 428 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.61 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3928  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 446 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0230  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.03 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.733178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  29.49 
 
 		 389 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0658  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1276  inner-membrane translocator  26.99 
 
 		 441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.521519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.5 
 
 		 424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 435 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2927  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.5 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1572  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.207353  normal  0.412707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  29.55 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0729  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1973  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  28.65 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  28.5 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  36.73 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1230  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1157  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0991659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  50 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 449 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  26.1 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  42.38 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  42.38 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4469  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3004  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 583 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 347 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2204  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 328 aa  96.7  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1581  inner-membrane translocator  25.27 
 
 		 363 aa  96.3  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845937  normal  0.47549 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0590  inner-membrane translocator  25 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.293157  hitchhiker  0.0000778251 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1113  branched-chain amino-acid ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 		 343 aa  94  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35 
 
 		 412 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  50 
 
 		 294 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1067  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0499919  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3841  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  36.63 
 
 		 321 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  25.2 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 		 350 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0474  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2157  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1578  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 344 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0304091  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.67 
 
 		 421 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0477  inner-membrane translocator  35 
 
 		 345 aa  90.9  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000104814  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 456 aa  90.5  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1160  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 		 350 aa  89.7  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.625358  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1760  inner-membrane translocator  25.27 
 
 		 361 aa  89.7  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0155295  hitchhiker  0.000793372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3962  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 295 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.31 
 
 		 317 aa  89.7  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.96 
 
 		 417 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.49 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50540  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.96 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0377625 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0444  inner-membrane translocator  28.77 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2250  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571474  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1035  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.977456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.59 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  37.59 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>