More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3014 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3014  inner-membrane translocator  100 
 
 		 330 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1230  inner-membrane translocator  52.73 
 
 		 322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  51.06 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  49.54 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1157  inner-membrane translocator  51.82 
 
 		 322 aa  293  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0991659  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1973  inner-membrane translocator  51.34 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  49.85 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3204  inner-membrane translocator  53.99 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2204  inner-membrane translocator  48.69 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0107  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.430419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  40 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  36.9 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0658  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 393 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 504 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  31.97 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 460 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 408 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  42.58 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 		 459 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.75 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  31.48 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  29.36 
 
 		 463 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  32.67 
 
 		 439 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 463 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.25 
 
 		 418 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  30.39 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  30 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0482  ABC transporter permease  31.8 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0325  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 377 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.39 
 
 		 423 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2396  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00825655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 452 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3324  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 484 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0986477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5436  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 475 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.51 
 
 		 571 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 353 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.09 
 
 		 428 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 436 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 294 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  27.76 
 
 		 412 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  30.7 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2857  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  28.19 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.78 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.97 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 407 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.34 
 
 		 423 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.97 
 
 		 417 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  27.62 
 
 		 418 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.02 
 
 		 423 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2250  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 464 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571474  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.02 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.02 
 
 		 423 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.02 
 
 		 423 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.02 
 
 		 423 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.39 
 
 		 427 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  27.68 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.39 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.39 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.25 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3705  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.25 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.25 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.95 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.08 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2317  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.39 
 
 		 425 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4331  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 443 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157197  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50540  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.97 
 
 		 417 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0377625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0400  ABC transporter permease  30.49 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3033  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 390 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235152  normal  0.243359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3018  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 358 aa  113  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5324  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  32.08 
 
 		 446 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538003  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1872  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  27.33 
 
 		 427 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal  0.0232173 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 347 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 463 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3064  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 426 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  29.32 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>