More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1040 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  100 
 
 		 436 aa  857    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  49.1 
 
 		 377 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3705  inner-membrane translocator  49.77 
 
 		 377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0325  inner-membrane translocator  62.57 
 
 		 377 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  62.3 
 
 		 377 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2771  inner-membrane translocator  61.73 
 
 		 371 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.176563  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  63.58 
 
 		 359 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  47.2 
 
 		 393 aa  137  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  46.01 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 314 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  37.99 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3014  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 322 aa  116  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0658  inner-membrane translocator  47.22 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  40.25 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1973  inner-membrane translocator  41.07 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1581  inner-membrane translocator  32.02 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1230  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1157  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0991659  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  40 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  41.57 
 
 		 329 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 504 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0590  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.293157  hitchhiker  0.0000778251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  40.99 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 294 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 		 307 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4469  inner-membrane translocator  44.53 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2097  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 440 aa  97.8  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.877591  normal  0.0148892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 300 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0444  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 359 aa  96.3  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 297 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3841  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3962  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 295 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  38.24 
 
 		 439 aa  93.6  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2204  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 328 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  34.55 
 
 		 565 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  39.71 
 
 		 297 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0107  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.430419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3390  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 295 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.635342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 390 aa  90.9  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1760  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 361 aa  90.5  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0155295  hitchhiker  0.000793372 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 358 aa  90.9  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2157  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 443 aa  90.1  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 339 aa  89.7  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0729  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1113  branched-chain amino-acid ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1035  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.977456  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1276  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 441 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.521519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.73 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5636  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.69 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  36.24 
 
 		 421 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64880  putative permease of ABC branched-chain amino acid transporter  36.69 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 317 aa  87  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4480  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 291 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.95 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 299 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  42.74 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0922  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.636778  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.93 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26110  ABC-transporter permease protein  37.68 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0693471  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845937  normal  0.47549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4743  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127702  hitchhiker  0.000000177935 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1067  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0499919  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0477  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000104814  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1160  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.625358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.14 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.44 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.44 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  37.75 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.44 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  34.44 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3928  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3204  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3572  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0134037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3018  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2843  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1572  inner-membrane translocator  44.04 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.207353  normal  0.412707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2493  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.55 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>