More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4469 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4469  inner-membrane translocator  100 
 
 		 295 aa  573  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3390  inner-membrane translocator  56.51 
 
 		 295 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.635342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1828  inner-membrane translocator  51.71 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6412  inner-membrane translocator  56.51 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00673549  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6645  inner-membrane translocator  56.51 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6243  inner-membrane translocator  56.16 
 
 		 295 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.928542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 314 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3962  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3841  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  33.44 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  33 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  30.26 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  31.82 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 463 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2752  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.12 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.12 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.12 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.12 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.12 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  31 
 
 		 339 aa  112  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.12 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 389 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1505  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.88 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.01 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 389 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.45 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 398 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 389 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7950  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172142  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 389 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.14 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.72 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5537  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 385 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.95 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 324 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 398 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 389 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  28.61 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 327 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0643  inner-membrane translocator  33.84 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 470 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  29.48 
 
 		 454 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0474  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  29.92 
 
 		 318 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  29.81 
 
 		 363 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 407 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 456 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 376 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1578  inner-membrane translocator  29.81 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0304091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  43.24 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2252  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  27.48 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 381 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 384 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  27.53 
 
 		 439 aa  99.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  26.81 
 
 		 378 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 341 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.01 
 
 		 412 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 337 aa  99  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 329 aa  99  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2030  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 385 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.710077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 332 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0358  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>