More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3705 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3705  inner-membrane translocator  100 
 
 		 377 aa  744    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2771  inner-membrane translocator  81.43 
 
 		 371 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.176563  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0325  inner-membrane translocator  57.45 
 
 		 377 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0332  inner-membrane translocator  57.45 
 
 		 377 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  60.58 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1040  inner-membrane translocator  49.77 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  50 
 
 		 359 aa  344  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 504 aa  159  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.68 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  42.28 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.62 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.67 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.67 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.67 
 
 		 423 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2955  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678807  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.58 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.89 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.7 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3014  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 330 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  46.62 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.61 
 
 		 459 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.88 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  28.25 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 460 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  44 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.51 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.51 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.19 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.51 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.23 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1973  inner-membrane translocator  40.49 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.23 
 
 		 423 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 454 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.96 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1746  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  42.28 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.88 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  29.44 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1276  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 441 aa  113  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.521519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 435 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5684  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 477 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.84 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  29.6 
 
 		 353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1230  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382884 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  28.07 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1157  inner-membrane translocator  41.06 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0991659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5324  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  30.48 
 
 		 446 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538003  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1621  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 445 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0814712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1581  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2157  inner-membrane translocator  28.17 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0658  inner-membrane translocator  44.14 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  39.41 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0729  inner-membrane translocator  27.91 
 
 		 424 aa  106  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2210  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component  28.93 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.689313  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2204  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1978  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  36.81 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.58235  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0590  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.293157  hitchhiker  0.0000778251 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3928  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  28.46 
 
 		 373 aa  99.8  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3324  inner-membrane translocator  28 
 
 		 484 aa  99.8  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0986477  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0444  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0601  inner-membrane translocator  35.68 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1517  hypothetical protein  35.95 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845937  normal  0.47549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0922  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 431 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.636778  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3415  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 295 aa  92.8  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0107  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.430419  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1760  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0155295  hitchhiker  0.000793372 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  37.97 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  25.79 
 
 		 663 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  30.81 
 
 		 339 aa  92  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2097  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.877591  normal  0.0148892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 408 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  42.73 
 
 		 312 aa  89.7  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 294 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 		 307 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2177  inner-membrane translocator  26.02 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1578  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0304091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  33.54 
 
 		 321 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  33.13 
 
 		 565 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  50.55 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3204  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4331  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  42.06 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3901  inner-membrane translocator  28.14 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>