More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3204 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3204  inner-membrane translocator  100 
 
 		 332 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  55.93 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3014  inner-membrane translocator  53.99 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  48.18 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  50.91 
 
 		 329 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1230  inner-membrane translocator  50.33 
 
 		 322 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1157  inner-membrane translocator  49.32 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0991659  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1973  inner-membrane translocator  52.45 
 
 		 328 aa  255  8e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2204  inner-membrane translocator  50 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0107  inner-membrane translocator  49.36 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.430419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  38.82 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0658  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  33.52 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 377 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.01 
 
 		 423 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.55 
 
 		 418 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  34.66 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.21 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 		 459 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.7 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.7 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.7 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 504 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 463 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  30.09 
 
 		 463 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3572  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0134037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.13 
 
 		 389 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3033  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 390 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235152  normal  0.243359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3018  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 443 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3064  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 426 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2843  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 391 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.01 
 
 		 423 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 339 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.01 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.01 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.7 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.7 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  32.27 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.7 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2396  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00825655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.06 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  27.83 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.53 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.22 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1546  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 452 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2317  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.01 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.13 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  27.22 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.85 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3625  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.7 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.53 
 
 		 421 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 449 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 415 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0729  inner-membrane translocator  28.75 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.21 
 
 		 421 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.49 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.83 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.49 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.83 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.83 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3962  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.83 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3841  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  27.66 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.17 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.83 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1828  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  27.88 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  26.06 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.97 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.49 
 
 		 418 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  29.55 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 407 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  28.43 
 
 		 424 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2250  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571474  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3324  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0986477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>