More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1230 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1230  inner-membrane translocator  100 
 
 
322 aa  633  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000382884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1157  inner-membrane translocator  95.65 
 
 
322 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0991659  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1183  branched-chain amino acid transport system permease protein  52.01 
 
 
328 aa  335  9e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0528852  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2204  inner-membrane translocator  55.32 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3014  inner-membrane translocator  52.73 
 
 
330 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1973  inner-membrane translocator  54.41 
 
 
328 aa  301  9e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267992  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0107  inner-membrane translocator  54.55 
 
 
328 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.430419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3157  inner-membrane translocator  49.69 
 
 
329 aa  288  7e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.849677  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2889  inner-membrane translocator  46.77 
 
 
329 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3204  inner-membrane translocator  50.33 
 
 
332 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3967  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
322 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4897  inner-membrane translocator  41.33 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0658  inner-membrane translocator  41.06 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1147  inner-membrane translocator  35.19 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2771  inner-membrane translocator  31.15 
 
 
371 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.176563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3087  inner-membrane translocator  34.17 
 
 
504 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1739  inner-membrane translocator  33.89 
 
 
449 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.66 
 
 
418 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1419  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
314 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0602  inner-membrane translocator  35.08 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.94 
 
 
423 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.04 
 
 
418 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1894  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids  47.02 
 
 
359 aa  136  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0493707  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0506  inner-membrane translocator  31.94 
 
 
339 aa  135  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.791289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.83 
 
 
421 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  30.99 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.94 
 
 
423 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.19 
 
 
421 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4883  inner-membrane translocator  45.64 
 
 
377 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.858319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3058  inner-membrane translocator  34.89 
 
 
408 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12681  hitchhiker  0.000339523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  34.06 
 
 
439 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.58 
 
 
424 aa  133  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.01 
 
 
428 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0230  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.97 
 
 
427 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.733178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
372 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.71 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  31.63 
 
 
452 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1385  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.8 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121753  normal  0.219132 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.83 
 
 
412 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3870  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.71 
 
 
425 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.37 
 
 
423 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.48 
 
 
418 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.83 
 
 
418 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.88 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.83 
 
 
418 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4057  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.72 
 
 
424 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.09 
 
 
423 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 
389 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.29 
 
 
423 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.83 
 
 
418 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  30.97 
 
 
463 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.41 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.09 
 
 
427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2250  inner-membrane translocator  32.35 
 
 
464 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571474  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.09 
 
 
427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.29 
 
 
423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0554  inner-membrane translocator  31.35 
 
 
433 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0237898  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3572  inner-membrane translocator  34.6 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0134037 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0106  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.4 
 
 
424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  31.21 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.29 
 
 
423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.29 
 
 
423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  33 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.29 
 
 
423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2843  inner-membrane translocator  34.31 
 
 
391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123701  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1487  inner-membrane translocator  31.47 
 
 
307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  32.08 
 
 
318 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  31.61 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.06 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  30.99 
 
 
326 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3018  inner-membrane translocator  33.53 
 
 
390 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  31.66 
 
 
389 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3033  inner-membrane translocator  33.84 
 
 
390 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235152  normal  0.243359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0729  inner-membrane translocator  31.68 
 
 
424 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  31.72 
 
 
463 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.07 
 
 
417 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.21 
 
 
389 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.21 
 
 
389 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.21 
 
 
389 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.21 
 
 
389 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  31.08 
 
 
389 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.21 
 
 
389 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.21 
 
 
389 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3064  inner-membrane translocator  33.84 
 
 
426 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  32.31 
 
 
389 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50540  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.36 
 
 
417 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0377625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  31.68 
 
 
389 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.21 
 
 
389 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  31.68 
 
 
389 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
389 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  31.68 
 
 
389 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  32.38 
 
 
321 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  31.15 
 
 
327 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5436  inner-membrane translocator  32.35 
 
 
475 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  31.37 
 
 
389 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3625  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.29 
 
 
423 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  31.39 
 
 
463 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5324  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  33.33 
 
 
446 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538003  normal  0.504195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>