More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56164 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_10191  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04270)  47.38 
 
 
1631 aa  752    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56164  TAT-binding homolog 7, AAA ATPase family  100 
 
 
1051 aa  2150    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04550  conserved hypothetical protein  50.9 
 
 
1577 aa  627  1e-178  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.246201  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17718  predicted protein  46.08 
 
 
1177 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42681  predicted protein  55.22 
 
 
290 aa  269  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539855  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.09 
 
 
718 aa  267  1e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.35 
 
 
753 aa  259  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.08 
 
 
727 aa  258  5e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.02 
 
 
723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  35.34 
 
 
754 aa  255  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.88 
 
 
732 aa  255  3e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.98 
 
 
757 aa  252  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  47.43 
 
 
769 aa  251  5e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.97 
 
 
768 aa  251  5e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.08 
 
 
721 aa  251  8e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.38 
 
 
742 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.3 
 
 
740 aa  249  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.06 
 
 
701 aa  249  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.14 
 
 
754 aa  248  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.53 
 
 
808 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.83 
 
 
738 aa  247  9e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.19 
 
 
754 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.81 
 
 
731 aa  245  3e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.24 
 
 
740 aa  245  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.52 
 
 
731 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 
810 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  41.83 
 
 
721 aa  244  6e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.59 
 
 
731 aa  244  9e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.38 
 
 
731 aa  243  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.31 
 
 
743 aa  243  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  46.15 
 
 
722 aa  243  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.97 
 
 
739 aa  243  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.2 
 
 
806 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.88 
 
 
757 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.68 
 
 
742 aa  242  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.36 
 
 
735 aa  241  5e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.69 
 
 
754 aa  241  5.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.1 
 
 
757 aa  241  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.61 
 
 
730 aa  240  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.98 
 
 
736 aa  240  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.12 
 
 
719 aa  240  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.61 
 
 
715 aa  239  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.79 
 
 
772 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  35.07 
 
 
713 aa  239  3e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.72 
 
 
704 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.47 
 
 
754 aa  238  6e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.96 
 
 
760 aa  237  7e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.34 
 
 
759 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.46 
 
 
709 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.31 
 
 
756 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  36.07 
 
 
806 aa  236  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  36.21 
 
 
732 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  33.83 
 
 
613 aa  234  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.93 
 
 
773 aa  234  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  34.66 
 
 
763 aa  234  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.01 
 
 
804 aa  233  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.72 
 
 
755 aa  233  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  46.24 
 
 
703 aa  232  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.59 
 
 
738 aa  233  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.57 
 
 
784 aa  232  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.72 
 
 
805 aa  232  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.12 
 
 
805 aa  232  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  33.96 
 
 
764 aa  230  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  42.65 
 
 
718 aa  230  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  45.9 
 
 
513 aa  230  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.31 
 
 
781 aa  230  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  36.32 
 
 
804 aa  229  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  42.12 
 
 
829 aa  229  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  33.12 
 
 
639 aa  229  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.43 
 
 
810 aa  228  6e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.54 
 
 
801 aa  228  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  32.97 
 
 
739 aa  227  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  35.61 
 
 
814 aa  227  9e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.98 
 
 
737 aa  226  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.2 
 
 
736 aa  227  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.98 
 
 
852 aa  225  3e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  34.4 
 
 
810 aa  225  4e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.51 
 
 
763 aa  224  7e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.87 
 
 
801 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  32.69 
 
 
699 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  31.14 
 
 
788 aa  219  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.72 
 
 
737 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.52 
 
 
738 aa  217  9e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  40.54 
 
 
775 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  52.05 
 
 
746 aa  216  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  40.66 
 
 
826 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.1 
 
 
781 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  34.56 
 
 
703 aa  214  7.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  44.4 
 
 
404 aa  213  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  44.36 
 
 
776 aa  212  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  41.02 
 
 
647 aa  212  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  43.87 
 
 
601 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  40.81 
 
 
413 aa  209  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  49.48 
 
 
800 aa  209  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  42.28 
 
 
387 aa  207  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  31.64 
 
 
832 aa  206  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  39.93 
 
 
415 aa  205  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  42.7 
 
 
436 aa  205  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  42.56 
 
 
386 aa  205  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  38.52 
 
 
405 aa  205  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>