156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43040 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  331  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  92.26 
 
 		 168 aa  307  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  90.8 
 
 		 167 aa  295  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  87.57 
 
 		 168 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  82.14 
 
 		 168 aa  280  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  71.08 
 
 		 166 aa  241  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  60.62 
 
 		 164 aa  202  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  55 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  54.66 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  53.12 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  53.12 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  50.93 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  50.93 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  51.55 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  52.17 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  50.31 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  53.85 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  52.56 
 
 		 167 aa  164  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  51.92 
 
 		 167 aa  162  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  50.93 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  46.84 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  47.02 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  45.86 
 
 		 166 aa  154  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  45.86 
 
 		 166 aa  154  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  44.87 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  49.39 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  45.51 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  45.51 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  45.57 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  45.57 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  45.57 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  45.16 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  39.74 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  39.74 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  39.74 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  39.74 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  39.74 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  39.74 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  39.74 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  38.41 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  39.62 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  37.34 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  38.13 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  37.11 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  39.33 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  39.57 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  32.92 
 
 		 166 aa  99  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0031  hypothetical protein  53.85 
 
 		 103 aa  94.4  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.841066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  37.18 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  36.13 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  30 
 
 		 200 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  35.76 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  31.87 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  33.96 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  34.38 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  33.13 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  33.15 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  33.15 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  33.55 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  33.55 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  33.55 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  30.68 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  32.94 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  32.9 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  34.06 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  34.06 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  34.06 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  34.06 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  34.06 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  32.34 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  31.82 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  32.68 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  29.8 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  33.33 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  33.54 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0032  hypothetical protein  53.45 
 
 		 58 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.865838  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  32.41 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  31.08 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  37.38 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  31.91 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  33.87 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  33.87 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  32.2 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  30.71 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  30.19 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  32 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6673  type VI secretion protein  28.99 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72757  normal  0.388479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  28.99 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  29.71 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  28.99 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>