156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0777 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  332  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  95.76 
 
 		 166 aa  317  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  95.76 
 
 		 166 aa  317  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  95.76 
 
 		 166 aa  316  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  95.76 
 
 		 166 aa  316  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  95.15 
 
 		 166 aa  313  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  94.55 
 
 		 166 aa  311  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  73.17 
 
 		 165 aa  253  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  73.17 
 
 		 165 aa  251  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  75.46 
 
 		 167 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  73.01 
 
 		 166 aa  247  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  69.38 
 
 		 171 aa  227  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  70.51 
 
 		 168 aa  227  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  67.09 
 
 		 170 aa  222  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  55.35 
 
 		 175 aa  190  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  52.83 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  42.67 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  42.94 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  38.96 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  40 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  38.18 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  38.18 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  39.33 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  39.33 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  41.03 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  39.74 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  38.41 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  37.58 
 
 		 166 aa  110  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  39.74 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  39.49 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  39.19 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  39.47 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  39.47 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  40.29 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  38 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  37.75 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  37.18 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  38.82 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  41.61 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  41.61 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  35.9 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  41.61 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  39.6 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  38.85 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  35.53 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  39.07 
 
 		 171 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  39.87 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  33.97 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  35.9 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  40 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  40 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  32.67 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  38.71 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  37.33 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  37.18 
 
 		 191 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  37.18 
 
 		 179 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  35.48 
 
 		 161 aa  90.5  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  37.18 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  34.73 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  37.01 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  35.53 
 
 		 187 aa  88.2  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  36.48 
 
 		 190 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  33.99 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  33.99 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  33.99 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  33.99 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  33.58 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  33.58 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  35.56 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  34.78 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  36.43 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  36.43 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  36.43 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0980  hypothetical protein  31.48 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  31.72 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  34.78 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6114  type VI secretion protein  32.35 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3907  type VI secretion protein  31.48 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406432 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  34.33 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  33.12 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3474  hypothetical protein  31.95 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279026  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  32.88 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  32.53 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  32.53 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  32.53 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  33.33 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  30.94 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  32.14 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  30.94 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>