156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5266 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  336  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  92.26 
 
 
171 aa  312  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  72.44 
 
 
166 aa  231  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  72.44 
 
 
166 aa  231  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  72.44 
 
 
166 aa  230  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  72.44 
 
 
166 aa  230  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  71.97 
 
 
166 aa  229  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  71.34 
 
 
166 aa  228  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  70.51 
 
 
166 aa  227  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  64.6 
 
 
165 aa  223  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  65.22 
 
 
166 aa  220  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  66.05 
 
 
170 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  66.88 
 
 
167 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  61.49 
 
 
165 aa  215  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  56.88 
 
 
175 aa  192  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  51.27 
 
 
200 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  45.75 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  42.28 
 
 
162 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  41.83 
 
 
168 aa  111  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  41.51 
 
 
165 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  41.51 
 
 
165 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  39.6 
 
 
168 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  41.51 
 
 
165 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  40.13 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  39.35 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  41.4 
 
 
167 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  41.4 
 
 
167 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  38.26 
 
 
165 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  40.85 
 
 
166 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  40.85 
 
 
166 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  39.38 
 
 
168 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  42.45 
 
 
167 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  43.97 
 
 
176 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  38.96 
 
 
164 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  39.33 
 
 
168 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  39.57 
 
 
166 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  40.27 
 
 
167 aa  101  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  38.06 
 
 
166 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  40.88 
 
 
167 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  40.71 
 
 
164 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  40.71 
 
 
164 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  40.71 
 
 
164 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  40.71 
 
 
164 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  40.71 
 
 
164 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  40.71 
 
 
164 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  40.71 
 
 
164 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  40.67 
 
 
166 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  38.65 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  43.57 
 
 
167 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  38.65 
 
 
167 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  38.65 
 
 
167 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  39.44 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  40.13 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  38.26 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  36.91 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  36.42 
 
 
177 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  41.06 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  41.45 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  37.58 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00266  hypothetical protein  39.58 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  33.74 
 
 
183 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  38.41 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  34 
 
 
168 aa  91.7  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  38.41 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  35.71 
 
 
179 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  35.71 
 
 
179 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  35.71 
 
 
179 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  37.86 
 
 
164 aa  90.9  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  38.36 
 
 
182 aa  90.9  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  37.75 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  37.41 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  34.13 
 
 
177 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  33.95 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  38.36 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  33.95 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  33.95 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  33.95 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26670  hypothetical protein (UCP028301)  37.76 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  38.73 
 
 
169 aa  89  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3474  hypothetical protein  34.93 
 
 
180 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279026  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  37.21 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3907  type VI secretion protein  34.93 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  34.88 
 
 
177 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  36.55 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  36.55 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  36.55 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  33.57 
 
 
179 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  36.69 
 
 
178 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  36.55 
 
 
193 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0980  hypothetical protein  33.56 
 
 
179 aa  87.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  34.13 
 
 
191 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  35.66 
 
 
168 aa  87  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  34.13 
 
 
179 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  34.9 
 
 
161 aa  87  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2871  hypothetical protein  37.41 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  34.13 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0941  type VI secretion protein, VC_A0107 family  36.55 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>