156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3649 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  100 
 
 		 170 aa  339  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  69.62 
 
 		 166 aa  228  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  69.62 
 
 		 166 aa  228  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  66.67 
 
 		 165 aa  227  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  68.99 
 
 		 166 aa  226  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  68.99 
 
 		 166 aa  226  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  68.99 
 
 		 166 aa  226  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  64.78 
 
 		 165 aa  225  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  68.35 
 
 		 166 aa  224  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  67.09 
 
 		 166 aa  222  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  67.28 
 
 		 171 aa  220  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  66.05 
 
 		 168 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  65.41 
 
 		 167 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  62.26 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  56.25 
 
 		 175 aa  185  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  53.29 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  46.05 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  44.67 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  40 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  39.22 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  40.76 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  41.03 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  39.62 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  41.72 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  40.4 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  40.4 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  41.89 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  41.14 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  37.91 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  37.91 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  37.25 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  38.06 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  38.82 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  38.82 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  38.82 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  38.82 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  38.82 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  38.82 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  38.82 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  40.67 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  40.26 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  37.58 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  37.58 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  37.58 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  36.13 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  36.13 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  38.55 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  35.71 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  41.06 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  38.41 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  41.13 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  34.9 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  45.53 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  40.27 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  42.86 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  38.06 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  40.27 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  44.72 
 
 		 191 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  44.72 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  44.72 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  44.72 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  91.3  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  35.14 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  40.88 
 
 		 180 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  32.45 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  40.52 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  40.52 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  40.52 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  40.52 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  39.66 
 
 		 183 aa  87.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  37.18 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  38.57 
 
 		 193 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  38.57 
 
 		 193 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  38.57 
 
 		 193 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  38.57 
 
 		 193 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  37.31 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  36 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  37.31 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  34.78 
 
 		 182 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  39.71 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  41.32 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  41.32 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  35.57 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  35.57 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  35.57 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  35.57 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  36.73 
 
 		 182 aa  84  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  35.57 
 
 		 171 aa  84  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  35.57 
 
 		 171 aa  84  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3850  type VI secretion protein  36.42 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1695  hypothetical protein  41.32 
 
 		 1238 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  38.06 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  38.19 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  38.19 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>