155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2814 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  56.88 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  55.62 
 
 		 171 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  55.97 
 
 		 166 aa  190  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  55.97 
 
 		 166 aa  190  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  55.35 
 
 		 166 aa  190  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  58.33 
 
 		 165 aa  190  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  54.04 
 
 		 165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  55.35 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  55.35 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  55 
 
 		 166 aa  188  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  54.37 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  56.25 
 
 		 170 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  51.57 
 
 		 167 aa  183  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  50 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  49.09 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  40.94 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  40.13 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  38.41 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  38.04 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  38.04 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  39.57 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  38.82 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  42.45 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  41.01 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  35 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  40.29 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  37.5 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  37.5 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  38.31 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  38.13 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  37.34 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  34.3 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  35 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  35 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  35.19 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  36.42 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  37.14 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  35.76 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  35.76 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  35.76 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  35.76 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  35.76 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  35.76 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  35.76 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  36.36 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  36.05 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.33 
 
 		 167 aa  101  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  36.23 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  34.44 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  36.2 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  36.08 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  36.08 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  36.08 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  36.69 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  34.62 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  35.58 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  36.08 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  35.58 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  39.13 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  35.71 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  42.24 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  36.91 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  34.62 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  34.62 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  34.62 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  34.62 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  34.62 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  36 
 
 		 168 aa  94.4  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  43.1 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  32.68 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  34.62 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  43.1 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  43.1 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  43.1 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  34.62 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  36.64 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  32.92 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  34.44 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  33.97 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.26 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  31.68 
 
 		 190 aa  92  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  32.65 
 
 		 177 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  31.97 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  31.97 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  31.97 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  33.75 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  30.67 
 
 		 176 aa  87.4  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  29.81 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  31.25 
 
 		 161 aa  85.5  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2443  hypothetical protein  30.77 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.485859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0941  type VI secretion protein, VC_A0107 family  32.91 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  31.33 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  31.25 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0155  hypothetical protein  35.34 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01010  hypothetical protein  35.34 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>