155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2268 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  83.05 
 
 
177 aa  300  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  82.49 
 
 
177 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  83.63 
 
 
179 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  83.63 
 
 
179 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  83.04 
 
 
191 aa  292  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  64.42 
 
 
166 aa  218  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  62.11 
 
 
170 aa  207  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  60.87 
 
 
170 aa  206  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  60.71 
 
 
182 aa  206  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  60.61 
 
 
171 aa  204  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  60.61 
 
 
171 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  60.61 
 
 
171 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  60.61 
 
 
171 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  60 
 
 
171 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  60 
 
 
171 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  60 
 
 
171 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  61.88 
 
 
172 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  61.88 
 
 
172 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  61.88 
 
 
172 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  61.88 
 
 
172 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  58.28 
 
 
176 aa  201  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  57.67 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  55.37 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  54.39 
 
 
187 aa  192  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  56.89 
 
 
176 aa  187  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  57.76 
 
 
167 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  56.41 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  56.41 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  55.62 
 
 
168 aa  175  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  52.44 
 
 
166 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  50 
 
 
182 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  48.55 
 
 
193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  48.55 
 
 
193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  51.81 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  47.98 
 
 
193 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  47.98 
 
 
193 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  47.98 
 
 
193 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  47.98 
 
 
193 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3474  hypothetical protein  47.13 
 
 
180 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279026  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  52.2 
 
 
171 aa  158  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6114  type VI secretion protein  46.2 
 
 
177 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  46.37 
 
 
178 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  49.03 
 
 
190 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  48.45 
 
 
186 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  48.15 
 
 
179 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  48.15 
 
 
179 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  48.15 
 
 
179 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  48.45 
 
 
186 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26670  hypothetical protein (UCP028301)  48.3 
 
 
188 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  48.45 
 
 
186 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6673  type VI secretion protein  46.37 
 
 
185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72757  normal  0.388479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0550  type VI secretion protein, VC_A0107 family  48.57 
 
 
172 aa  153  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2871  hypothetical protein  46.91 
 
 
174 aa  152  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1479  type VI secretion protein  46.91 
 
 
174 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276644  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  47.85 
 
 
167 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1367  hypothetical protein  46.91 
 
 
174 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.466171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0980  hypothetical protein  45.66 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  49.02 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0941  type VI secretion protein, VC_A0107 family  47.5 
 
 
181 aa  151  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2322  hypothetical protein  44.51 
 
 
171 aa  151  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239725  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  46.91 
 
 
179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3850  type VI secretion protein  47.47 
 
 
180 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453706  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  46.71 
 
 
182 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3907  type VI secretion protein  45.03 
 
 
179 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2461  type VI secretion protein, VC_A0107 family  48.45 
 
 
176 aa  147  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1695  hypothetical protein  49.4 
 
 
1238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  45.66 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  45.4 
 
 
180 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  44.77 
 
 
168 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01010  hypothetical protein  42.29 
 
 
172 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  46.58 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  46.58 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  46.58 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0155  hypothetical protein  41.71 
 
 
172 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3003  hypothetical protein  45.34 
 
 
178 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0193  type VI secretion protein, VC_A0107 family  44.59 
 
 
189 aa  140  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  45.1 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  45.1 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  45.1 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  45.1 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  44.44 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  42.68 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  42.68 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1588  hypothetical protein  43.87 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149001  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  42.68 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  42.68 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0403  hypothetical protein  42.04 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1600  hypothetical protein  42.04 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1783  hypothetical protein  42.04 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0453  hypothetical protein  42.04 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00266  hypothetical protein  41.55 
 
 
150 aa  117  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  42.42 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  39.88 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  41.14 
 
 
170 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0438  hypothetical protein  43.75 
 
 
141 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  38.24 
 
 
167 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  36.05 
 
 
175 aa  101  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  39.87 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  39.44 
 
 
165 aa  99  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>