156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0278 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  317  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  81.25 
 
 		 161 aa  254  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  55 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  54.32 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  53.75 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  56.44 
 
 		 164 aa  184  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  54.6 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  54.6 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  54.6 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  54.6 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  54.66 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  54.6 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  54.6 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  54.6 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  53.12 
 
 		 168 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  52.83 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  51.88 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  54.49 
 
 		 165 aa  174  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  52.83 
 
 		 168 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  52.2 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  51.61 
 
 		 167 aa  170  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  50.32 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  50.32 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  50.32 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  49.38 
 
 		 166 aa  166  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  51.2 
 
 		 167 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  51.2 
 
 		 167 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  49.37 
 
 		 169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  48.1 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  48.1 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  48.1 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  50.62 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  50.62 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  51.88 
 
 		 167 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  51.88 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  50.62 
 
 		 167 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  50.62 
 
 		 167 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  49.69 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  45.45 
 
 		 161 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  42.04 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  44.67 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  41.33 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  41.33 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  41.33 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  41.33 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  41.33 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  41.33 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  42.28 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  38.67 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  38 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  35.33 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  40.27 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  40.13 
 
 		 168 aa  102  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  38 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  36.31 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  36.23 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  37.25 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  38.67 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0031  hypothetical protein  48.45 
 
 		 103 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.841066  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  39.22 
 
 		 167 aa  94.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  35.71 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  32.89 
 
 		 200 aa  87.8  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  33.75 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  32.24 
 
 		 176 aa  84  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  36.6 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  37.66 
 
 		 191 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  37.66 
 
 		 179 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  37.66 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  37.01 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  39.34 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  35.62 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  35.06 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  37.16 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  37.16 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  37.16 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  37.16 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  36.36 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  40.98 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  36.49 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  36.49 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  40.98 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  40.98 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  40.16 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0032  hypothetical protein  60.34 
 
 		 58 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.865838  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  40.98 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  34.9 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  37.29 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  37.29 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  37.29 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  37.29 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  32.45 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  32.61 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  38.52 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  37.61 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  32.61 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  32.61 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  34.87 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.25 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3121  hypothetical protein  32.24 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241786  normal  0.0428701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0941  type VI secretion protein, VC_A0107 family  34.93 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>