155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0011 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  330  6e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  50.62 
 
 		 164 aa  170  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  50.93 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  50.62 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  48.75 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  47.83 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  48.47 
 
 		 166 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  46.88 
 
 		 167 aa  154  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  46.58 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  47.31 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  47.31 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  47.31 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  48.8 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  48.1 
 
 		 167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  45.68 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  45.57 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  46.88 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  45.06 
 
 		 168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  50.33 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  43.95 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  44.94 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  44.94 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  45.91 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  44.94 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  44.94 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  45.91 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  44.94 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  44.94 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  44.94 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  45.91 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  45.62 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  45.62 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  44.94 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  45.83 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  45.83 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  42.04 
 
 		 162 aa  141  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  44.94 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  46.2 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  43.23 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  46.79 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  34.62 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  34.62 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  35.26 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  34.62 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  34.62 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  34.62 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  33.97 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  35.03 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  33.76 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  36.67 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  36 
 
 		 175 aa  94.4  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  34 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  34 
 
 		 168 aa  91.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  32.34 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  31.82 
 
 		 167 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  32.45 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  31.58 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  30.92 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  30.92 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  30.92 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0031  hypothetical protein  43.43 
 
 		 103 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.841066  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  34.48 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  34.48 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  34.48 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  34.48 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  30.26 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  33.79 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  33.79 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  31.03 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  34.31 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  31.37 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  34.31 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  34.31 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  33.58 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  35.16 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  32.85 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  33.33 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  31.85 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  31.14 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  27.86 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  31.82 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  33.8 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  31.39 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  32.24 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  28.28 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  32.45 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  31.09 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26670  hypothetical protein (UCP028301)  32.48 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0032  hypothetical protein  53.57 
 
 		 58 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.865838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  29.06 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  29.06 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  32.48 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  28.77 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2871  hypothetical protein  32.2 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1479  type VI secretion protein  32.2 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1367  hypothetical protein  32.2 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.466171  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1695  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1238 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  29.06 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  29.06 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>