156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0247 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  335  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  98.19 
 
 
166 aa  328  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  98.19 
 
 
166 aa  328  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  76.05 
 
 
167 aa  267  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  76.05 
 
 
167 aa  267  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  62.65 
 
 
165 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  62.65 
 
 
165 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  62.65 
 
 
165 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  58.13 
 
 
162 aa  191  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  59.15 
 
 
167 aa  190  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  56.71 
 
 
167 aa  185  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  56.71 
 
 
167 aa  185  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  55.41 
 
 
167 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  55 
 
 
169 aa  180  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  54.6 
 
 
167 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  53.99 
 
 
167 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  55 
 
 
165 aa  174  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  53.12 
 
 
166 aa  165  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  51.53 
 
 
167 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  45.51 
 
 
168 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  49.69 
 
 
162 aa  154  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  44.87 
 
 
167 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  44.87 
 
 
168 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  47.31 
 
 
168 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  43.59 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  46.91 
 
 
161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  41.67 
 
 
166 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  43.31 
 
 
168 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  44.94 
 
 
168 aa  143  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  44.3 
 
 
168 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  44.23 
 
 
164 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  42.17 
 
 
164 aa  137  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  43.59 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  43.59 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  45.51 
 
 
161 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  43.59 
 
 
164 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  43.59 
 
 
164 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  43.59 
 
 
164 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  43.59 
 
 
164 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  43.59 
 
 
164 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  38.79 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  38.79 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  37.35 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  37.58 
 
 
166 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  37.35 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  37.58 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  37.58 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0031  hypothetical protein  59.14 
 
 
103 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.841066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  37.2 
 
 
166 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  34.3 
 
 
175 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  37.41 
 
 
165 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  37.8 
 
 
171 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  35.71 
 
 
200 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  35.71 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  33.13 
 
 
165 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  34.36 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  36.91 
 
 
167 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  37.33 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  34.9 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  34.23 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  33.77 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  33.77 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  30.07 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  32.53 
 
 
183 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  33.77 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  33.11 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  33.11 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  31.79 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  32 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  29.8 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  32.89 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0032  hypothetical protein  58.33 
 
 
58 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.865838  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  30.59 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  35.11 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  35.11 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  35.11 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  28.86 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0193  type VI secretion protein, VC_A0107 family  32.47 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  34.53 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1588  hypothetical protein  33.9 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149001  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  33.9 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  31.97 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  31.97 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  33.9 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  33.9 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  31.97 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  31.97 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3477  hypothetical protein  32.26 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772504  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3121  hypothetical protein  32.26 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241786  normal  0.0428701 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2461  type VI secretion protein, VC_A0107 family  34.75 
 
 
176 aa  61.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  32.2 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0155  hypothetical protein  34.17 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  31.76 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  31.15 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01010  hypothetical protein  34.17 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26670  hypothetical protein (UCP028301)  36.89 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1600  hypothetical protein  33.05 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1783  hypothetical protein  33.05 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  32.79 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>