156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3255 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  100 
 
 		 167 aa  330  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  98.8 
 
 		 167 aa  327  6e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  95.81 
 
 		 167 aa  320  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  70.51 
 
 		 165 aa  227  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  70.51 
 
 		 165 aa  227  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  70.51 
 
 		 165 aa  227  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  65 
 
 		 166 aa  216  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  68.59 
 
 		 165 aa  216  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  64.63 
 
 		 169 aa  207  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  62.5 
 
 		 162 aa  202  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  58.54 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  58.54 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  58.02 
 
 		 167 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  58.02 
 
 		 167 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  56.71 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  55.83 
 
 		 167 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  55.83 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  55.83 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  53.5 
 
 		 168 aa  174  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  54.6 
 
 		 167 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  53.55 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  52.17 
 
 		 168 aa  170  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  52.9 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  50.32 
 
 		 162 aa  167  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  52.56 
 
 		 168 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  51.28 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  49.36 
 
 		 166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  48.73 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  46.88 
 
 		 164 aa  160  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  48.75 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  48.75 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  50.62 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  48.75 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  48.75 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  48.75 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  48.75 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  48.75 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  50.64 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  51.97 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  45.62 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0031  hypothetical protein  60 
 
 		 103 aa  117  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.841066  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  39.74 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  38.46 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  38.46 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  38.46 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  35.71 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  36.13 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  36.36 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  38.96 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  37.58 
 
 		 168 aa  94.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  36.77 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  35.9 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  35.44 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0032  hypothetical protein  66.67 
 
 		 58 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.865838  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  38.93 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  38.93 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  38.26 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  38.26 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  38.26 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  38.26 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  32.28 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  34.9 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  34.9 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  34.9 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  31.41 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  34.23 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  31.58 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  32.67 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  31.76 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  37.23 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  32.24 
 
 		 176 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  32.43 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  31.51 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3477  hypothetical protein  32.87 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772504  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3121  hypothetical protein  32.87 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241786  normal  0.0428701 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  31.94 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.77 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  31.76 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  32.59 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  32.59 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  31.76 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  32.59 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  32.59 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  31.76 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  31.08 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  33.33 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2443  hypothetical protein  30.34 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.485859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  31.29 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  33.9 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  34.75 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  33.05 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  33.05 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  33.9 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  33.9 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>