156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1783 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  332  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  88.41 
 
 
165 aa  298  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  74.39 
 
 
166 aa  255  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  74.39 
 
 
166 aa  255  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  73.78 
 
 
166 aa  252  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  73.78 
 
 
166 aa  252  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  73.33 
 
 
166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  73.17 
 
 
166 aa  251  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  72.73 
 
 
166 aa  249  9.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  67.07 
 
 
166 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  70.81 
 
 
167 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  66.67 
 
 
170 aa  227  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  65.84 
 
 
171 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  64.6 
 
 
168 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  58.33 
 
 
175 aa  190  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  49.06 
 
 
200 aa  164  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  41.33 
 
 
168 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  41.33 
 
 
168 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  41.22 
 
 
167 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  41.22 
 
 
167 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  42 
 
 
169 aa  114  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  40.38 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  40.28 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  41.21 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  41.21 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  41.21 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  38.65 
 
 
168 aa  111  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  38.67 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  38.1 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  38.1 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  37.34 
 
 
168 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  38.46 
 
 
167 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  40.29 
 
 
168 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  38.46 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  38.82 
 
 
162 aa  108  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  36.94 
 
 
167 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  39.07 
 
 
171 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  38.36 
 
 
167 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  37.41 
 
 
166 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  37.41 
 
 
168 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  37.18 
 
 
168 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  37.41 
 
 
166 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  37.74 
 
 
161 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  35.26 
 
 
164 aa  101  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  34.87 
 
 
164 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  34.87 
 
 
164 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  34.87 
 
 
164 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  34.87 
 
 
164 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  34.87 
 
 
164 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  34.87 
 
 
164 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  34.87 
 
 
164 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  35.53 
 
 
164 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  38.41 
 
 
166 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  35.03 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  38.69 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  39.44 
 
 
177 aa  99  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  38.62 
 
 
167 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  36.48 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  38.62 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  37.82 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  36.14 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  34.91 
 
 
187 aa  94  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  35.03 
 
 
176 aa  94  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  38.58 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  38.24 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  36.24 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  34.5 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  37.98 
 
 
161 aa  89  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  37.75 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  37.5 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  36.76 
 
 
191 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  36.76 
 
 
179 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  34.62 
 
 
193 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  35.33 
 
 
179 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  36.76 
 
 
179 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  32.21 
 
 
181 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  34.62 
 
 
193 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  34.62 
 
 
193 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  35.33 
 
 
179 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  35.33 
 
 
179 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  34.62 
 
 
193 aa  84.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  32.21 
 
 
181 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0550  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.71 
 
 
172 aa  84.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  34.53 
 
 
182 aa  84.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3474  hypothetical protein  34.42 
 
 
180 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279026  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  35.82 
 
 
170 aa  84  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  32.86 
 
 
182 aa  84  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3850  type VI secretion protein  31.82 
 
 
180 aa  84  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453706  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  34.84 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  32.9 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6673  type VI secretion protein  35.06 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72757  normal  0.388479 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  33.97 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  33.97 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  33.99 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  33.1 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  33.1 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  33.99 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  33.1 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  33.99 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>