154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3406 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  356  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  87.73 
 
 		 187 aa  287  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  79.56 
 
 		 181 aa  277  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  79.56 
 
 		 181 aa  277  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  60.59 
 
 		 177 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  58.72 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  61.54 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  61.54 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  60.9 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  55.37 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  54.44 
 
 		 182 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  57.4 
 
 		 176 aa  185  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  56.88 
 
 		 190 aa  184  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  55.62 
 
 		 176 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  53.85 
 
 		 170 aa  174  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  53.85 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  54.09 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  54.09 
 
 		 172 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  54.09 
 
 		 172 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  54.09 
 
 		 172 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  54.49 
 
 		 171 aa  170  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  54.49 
 
 		 171 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  54.49 
 
 		 171 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  54.49 
 
 		 171 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  54.49 
 
 		 171 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  53.85 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  53.85 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  52.44 
 
 		 182 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  50.64 
 
 		 170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  48.75 
 
 		 168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  49.68 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  48.43 
 
 		 167 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  48.68 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  45.83 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140512 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  46.06 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  45.81 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0550  type VI secretion protein, VC_A0107 family  44.51 
 
 		 172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  45.22 
 
 		 169 aa  144  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3850  type VI secretion protein  42.77 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2461  type VI secretion protein, VC_A0107 family  47.74 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  45.4 
 
 		 193 aa  140  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  43.12 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  43.12 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26670  hypothetical protein (UCP028301)  45.64 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0193  type VI secretion protein, VC_A0107 family  42.51 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  48.63 
 
 		 192 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  48.63 
 
 		 192 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  48.63 
 
 		 192 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1588  hypothetical protein  47.3 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149001  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3474  hypothetical protein  42.24 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279026  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  41.67 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6114  type VI secretion protein  40.72 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0941  type VI secretion protein, VC_A0107 family  42.26 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  42.5 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  42.5 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  42.5 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  42.5 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3907  type VI secretion protein  42.24 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406432 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0403  hypothetical protein  47.95 
 
 		 192 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1600  hypothetical protein  47.95 
 
 		 192 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1783  hypothetical protein  47.95 
 
 		 192 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0453  hypothetical protein  47.95 
 
 		 192 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  40.94 
 
 		 179 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0980  hypothetical protein  41.82 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2322  hypothetical protein  43.04 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239725  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3003  hypothetical protein  43.12 
 
 		 178 aa  134  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1695  hypothetical protein  43.59 
 
 		 1238 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  41.71 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  44.3 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  44.3 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  44.3 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01010  hypothetical protein  42.41 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0155  hypothetical protein  42.41 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  43.62 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6673  type VI secretion protein  41.34 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72757  normal  0.388479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  40.11 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  37.21 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  37.21 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  37.21 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  37.21 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1479  type VI secretion protein  40.24 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  40.35 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2871  hypothetical protein  40.24 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1367  hypothetical protein  40.24 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.466171  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  39.1 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  44.59 
 
 		 180 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  41.14 
 
 		 180 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  41.14 
 
 		 180 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  38.85 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  38.85 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  38.85 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00266  hypothetical protein  40.69 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  39.88 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  36.07 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  41.45 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0438  hypothetical protein  34.06 
 
 		 141 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874563  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3477  hypothetical protein  34.15 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2443  hypothetical protein  35.1 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.485859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3121  hypothetical protein  35.03 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241786  normal  0.0428701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  40.79 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>