156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3123 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  328  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  73.62 
 
 
166 aa  248  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  73.62 
 
 
166 aa  248  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  73.01 
 
 
166 aa  247  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  72.56 
 
 
166 aa  245  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  73.01 
 
 
166 aa  245  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  73.01 
 
 
166 aa  245  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  67.07 
 
 
165 aa  244  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  71.95 
 
 
166 aa  242  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  67.07 
 
 
165 aa  237  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  70.19 
 
 
167 aa  230  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  67.7 
 
 
171 aa  222  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  65.22 
 
 
168 aa  220  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  62.26 
 
 
170 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  49.09 
 
 
175 aa  169  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0161  hypothetical protein  49.38 
 
 
200 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  39.33 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  39.33 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  37.74 
 
 
169 aa  110  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  37.8 
 
 
166 aa  107  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  37.8 
 
 
166 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  37.2 
 
 
166 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  40.26 
 
 
167 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  40.26 
 
 
167 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  36.31 
 
 
162 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  38.99 
 
 
165 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  38.99 
 
 
165 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  38.99 
 
 
165 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  37.91 
 
 
168 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  36.03 
 
 
165 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  32.92 
 
 
168 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  37.25 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  34.21 
 
 
164 aa  97.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  34.21 
 
 
164 aa  97.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  34.21 
 
 
164 aa  97.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  37.23 
 
 
162 aa  97.4  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  34.21 
 
 
164 aa  97.1  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  34.21 
 
 
164 aa  97.1  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  34.21 
 
 
164 aa  97.1  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  34.21 
 
 
164 aa  97.1  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  34.21 
 
 
164 aa  97.1  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  36.67 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  33.77 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  32.67 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.9 
 
 
167 aa  95.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  37.28 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.9 
 
 
167 aa  94.4  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  38 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.9 
 
 
167 aa  94  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  32.69 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  32.45 
 
 
166 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  37.21 
 
 
180 aa  89  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  34.84 
 
 
177 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  33.77 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  34.23 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  34.64 
 
 
171 aa  87.8  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  32.91 
 
 
167 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  35.57 
 
 
181 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  35.57 
 
 
181 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  36.42 
 
 
190 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  30.77 
 
 
164 aa  87  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  30.71 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  34.23 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  34.23 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  34.39 
 
 
191 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  34.44 
 
 
161 aa  84  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  35.44 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  34.81 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  34.39 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  34.39 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  34.39 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  33.73 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  31.29 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  34.87 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  33.12 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  32.67 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  32.67 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  34.87 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  32.67 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  34.87 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  32.67 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  32.08 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  32.08 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  32.08 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  32.08 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  33.97 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  33.97 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  33.97 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  33.97 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  33.1 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  32.62 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  34.33 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0403  hypothetical protein  34.21 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1600  hypothetical protein  34.21 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1783  hypothetical protein  34.21 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0453  hypothetical protein  34.21 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3850  type VI secretion protein  32.91 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>