155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4953 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  353  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  94.92 
 
 		 177 aa  338  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  92.13 
 
 		 179 aa  328  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  92.66 
 
 		 179 aa  328  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  91.57 
 
 		 191 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  82.49 
 
 		 177 aa  299  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  63.8 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  61.49 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  61.49 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  58.72 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  60.26 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  54.86 
 
 		 176 aa  198  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  58.79 
 
 		 171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  58.79 
 
 		 171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  58.79 
 
 		 171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  58.79 
 
 		 171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  58.28 
 
 		 182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  58.18 
 
 		 171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  58.18 
 
 		 171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  58.18 
 
 		 171 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  54.29 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  58.64 
 
 		 172 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  58.64 
 
 		 172 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  58.64 
 
 		 172 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  58.64 
 
 		 172 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  59.62 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  59.62 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  57.5 
 
 		 168 aa  184  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  52.3 
 
 		 176 aa  174  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  54.04 
 
 		 167 aa  174  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  53.66 
 
 		 166 aa  167  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  48.45 
 
 		 193 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  48.45 
 
 		 193 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  52.9 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3474  hypothetical protein  47.53 
 
 		 180 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279026  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  48.21 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6114  type VI secretion protein  45.83 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  47.83 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  51.57 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  47.83 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  47.83 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  47.83 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  50.98 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  47.53 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  47.53 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  47.53 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26670  hypothetical protein (UCP028301)  47.16 
 
 		 188 aa  150  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  47.83 
 
 		 169 aa  150  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2871  hypothetical protein  46.58 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1479  type VI secretion protein  46.58 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276644  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0980  hypothetical protein  47.13 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1367  hypothetical protein  46.58 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.466171  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  47.02 
 
 		 178 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  46.3 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0941  type VI secretion protein, VC_A0107 family  46.88 
 
 		 181 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3850  type VI secretion protein  44.25 
 
 		 180 aa  148  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  47.71 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3907  type VI secretion protein  44.19 
 
 		 179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406432 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6673  type VI secretion protein  45.98 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72757  normal  0.388479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  44.63 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1695  hypothetical protein  49.35 
 
 		 1238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  46.71 
 
 		 168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140512 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  43.56 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  43.56 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  43.56 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2322  hypothetical protein  44.59 
 
 		 171 aa  144  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239725  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2461  type VI secretion protein, VC_A0107 family  47.8 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0550  type VI secretion protein, VC_A0107 family  46.86 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0193  type VI secretion protein, VC_A0107 family  43.4 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  44.24 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  46.58 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  46.58 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  46.58 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  46.58 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01010  hypothetical protein  42.59 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0155  hypothetical protein  41.98 
 
 		 172 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3003  hypothetical protein  44.03 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  43.67 
 
 		 193 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  42.41 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  42.41 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  42.41 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1588  hypothetical protein  43.87 
 
 		 184 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149001  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0403  hypothetical protein  41.77 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  40.65 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1600  hypothetical protein  41.77 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1783  hypothetical protein  41.77 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  40.65 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  40.65 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0453  hypothetical protein  41.77 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  40.65 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00266  hypothetical protein  41.55 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  40.94 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  42.07 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  41.91 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  41.91 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  41.91 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  41.91 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  45.53 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>