157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1181 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1181  type VI secretion protein  100 
 
 
161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3733  hypothetical protein  49.35 
 
 
165 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2529  type VI secretion protein  49.68 
 
 
162 aa  157  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2807  type VI secretion protein, VC_A0107 family  53.29 
 
 
167 aa  156  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1196  hypothetical protein  50.65 
 
 
166 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1070  type VI secretion protein, VC_A0107 family  51.97 
 
 
167 aa  153  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.533436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3255  type VI secretion protein, VC_A0107 family  51.97 
 
 
167 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3905  hypothetical protein  50.65 
 
 
165 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0386  type VI secretion protein  50.65 
 
 
165 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0313  hypothetical protein  50.65 
 
 
165 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0239  hypothetical protein  49.36 
 
 
166 aa  147  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0241  hypothetical protein  49.36 
 
 
166 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43040  hypothetical protein  45.16 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0011  hypothetical protein  50.33 
 
 
168 aa  144  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  45.68 
 
 
168 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3615  hypothetical protein  45.16 
 
 
168 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0045  hypothetical protein  46.15 
 
 
169 aa  144  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0247  hypothetical protein  46.91 
 
 
166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.788284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0278  hypothetical protein  45.45 
 
 
162 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0090  hypothetical protein  47.1 
 
 
168 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4074  hypothetical protein  48.68 
 
 
167 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000649214  unclonable  0.000000799186 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0870  hypothetical protein  48.39 
 
 
164 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  45.06 
 
 
168 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3172  hypothetical protein  45.45 
 
 
161 aa  140  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5595  hypothetical protein  44.52 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0744  hypothetical protein  45.81 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0196457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0533  hypothetical protein  45.81 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0604  hypothetical protein  45.81 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0715  hypothetical protein  45.81 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.750715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2123  hypothetical protein  45.81 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2025  hypothetical protein  45.81 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1672  hypothetical protein  45.81 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.873681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5433  hypothetical protein  44.23 
 
 
168 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2624  hypothetical protein  45.39 
 
 
167 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.799752  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2543  hypothetical protein  44.52 
 
 
166 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0150995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1231  type VI secretion protein  46.15 
 
 
167 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.137782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1111  type VI secretion protein, family  46.15 
 
 
167 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1124  putative type VI secretion protein VasQ  44.16 
 
 
164 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2127  hypothetical protein  45.39 
 
 
167 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3224  type VI secretion protein  44.81 
 
 
167 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  36.64 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0777  hypothetical protein  35.48 
 
 
166 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3649  type VI secretion protein  35.14 
 
 
170 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1783  hypothetical protein  37.98 
 
 
165 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.309687  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0031  hypothetical protein  47.83 
 
 
103 aa  89  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.841066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2978  hypothetical protein  34.84 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000439438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0726  hypothetical protein  34.84 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2511  hypothetical protein  34.84 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  35.76 
 
 
165 aa  87.4  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.318874 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  34.9 
 
 
168 aa  87  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  36.51 
 
 
172 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  38.02 
 
 
172 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2600  type VI secretion protein  34.19 
 
 
166 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  36.51 
 
 
172 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  36.51 
 
 
172 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0798  type VI secretion protein  34.19 
 
 
166 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0176  hypothetical protein  34.19 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.026937  hitchhiker  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  34.92 
 
 
182 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0625  hypothetical protein  35.77 
 
 
171 aa  84.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  35.71 
 
 
171 aa  84.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3123  hypothetical protein  34.44 
 
 
166 aa  84  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.489353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  31.65 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  31.65 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  31.65 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  31.65 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  31.65 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  31.65 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  36.52 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  31.33 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  33.86 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3261  type VI secretion protein  33.54 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30542  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  32.54 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1588  hypothetical protein  35.71 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149001  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  38.26 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  36.51 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  31.17 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2461  type VI secretion protein, VC_A0107 family  39.68 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.38 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  36.92 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  34.48 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  34.48 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  30.97 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  36.92 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  36.92 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  37.01 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  37.01 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  36.92 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  34.48 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  28.67 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  38.21 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1479  type VI secretion protein  34.01 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276644  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  37.4 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2871  hypothetical protein  34.01 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  30 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  37.39 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  30 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  38.21 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1367  hypothetical protein  34.01 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.466171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>