95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_88222 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009363  OSTLU_88222  predicted protein  100 
 
 		 311 aa  648    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0289002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3896  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.94 
 
 		 152 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01575  hypothetical protein  46.1 
 
 		 153 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2330  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.24 
 
 		 162 aa  95.9  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18358  hitchhiker  0.00000314878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3372  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.77 
 
 		 203 aa  89  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01885  putative cold-shock RNA methyltransferase  34.78 
 
 		 182 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1395  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.55 
 
 		 178 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.502759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1287  putative RNA methyltransferase  34.46 
 
 		 152 aa  84  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3116  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.85 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4585  RNA methyltransferase  32.65 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1304  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.65 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.93 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4108  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.65 
 
 		 156 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1569  hypothetical protein  31.97 
 
 		 166 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00445287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3916  hypothetical protein  31.97 
 
 		 165 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.919251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3418  hypothetical protein  31.47 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0544122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2233  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.03 
 
 		 198 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.237391  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07014  23S rRNA methyltransferase  32.39 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2584  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.56 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0567  putative rRNA methylase  30.99 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.96226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1568  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.94 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000175269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1642  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.29 
 
 		 177 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00428557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3894  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.03 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2842  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.67 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.002241  decreased coverage  0.0000781436 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1420  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.88 
 
 		 202 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1485  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.88 
 
 		 202 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.86 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.145291  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4113  RNA methyltransferase  28.21 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1611  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.67 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050624  normal  0.825884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2748  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.67 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20465  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1473  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.08 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.253583 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0754  rRNA methylase (SpoU_methylase)  27.7 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3075  RNA methyltransferase  27.4 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2765  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.04 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000737812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2719  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.08 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.159423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2447  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.04 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000932167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2412  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.21 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2663  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.57 
 
 		 180 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.299064  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.03 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3013  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.85 
 
 		 177 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0108117  normal  0.339909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.03 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  24.03 
 
 		 258 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12053  predicted protein  22.39 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00023289  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein  28.26 
 
 		 161 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.029361 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0050  RNA methyltransferase  28 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4172  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.97 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3859  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.32 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3914  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.27 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0187406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2787  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.74 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0411  RNA methyltransferase  26.67 
 
 		 249 aa  49.3  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1304  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.36 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  23.95 
 
 		 188 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14671  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  24.83 
 
 		 166 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0364  RNA methyltransferase  22.49 
 
 		 181 aa  47.4  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0637729  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03790  rRNA methylase, putative, group 3  27.48 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000601463  normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.57 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  25 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.87 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1198  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  36.92 
 
 		 224 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0145  RNA methyltransferase  26.76 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0150  RNA methyltransferase  26.76 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  26.54 
 
 		 252 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.37 
 
 		 256 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31979  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  25.87 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl374  rRNA methyltransferase  23.67 
 
 		 179 aa  45.4  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000924245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0657  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.77 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0678  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.36 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.435122  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.27 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2423  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.217183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  25 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  24.48 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38470  rRNA methylase  24.68 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0504  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0482  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.26 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0493  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.26 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.490005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0471  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.26 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.37 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0733  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.36 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.329217 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  23.87 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0162  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.35 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  23.87 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0379  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  24.46 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0720  RNA methyltransferase  35.38 
 
 		 246 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3641  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.74 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.89326 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02030  rRNA methylase  24.03 
 
 		 234 aa  43.5  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28928  predicted protein  20.48 
 
 		 207 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145159  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0827  spoU rRNA methylase family protein  26.57 
 
 		 151 aa  43.1  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000730061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  21.97 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  24.82 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.59 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4212  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  22.29 
 
 		 230 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  22.52 
 
 		 387 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3982  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.32 
 
 		 213 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.549052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4585  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  23.4 
 
 		 231 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0102229  unclonable  0.0000000288798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0863  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.26 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>