More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4394 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  87.5 
 
 		 252 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  69.11 
 
 		 252 aa  321  6e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  62.14 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.45 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.76 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.26 
 
 		 315 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.89 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  41.6 
 
 		 247 aa  205  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  43.67 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  41.39 
 
 		 247 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  42.8 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  48.16 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.77 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  40.49 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.8 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.34 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.93 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  38.93 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  38.93 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.93 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  39.34 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.93 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.21 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.37 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.62 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  36.89 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  40.82 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  36.48 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19440  rRNA methylase, putative, group 3  40.74 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  41.74 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.62 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  40.98 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.27 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  40.57 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.74 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.36 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.32 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.37 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  36.4 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.91 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.98 
 
 		 239 aa  174  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.32 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.98 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  34.71 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.7 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.04 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  43.95 
 
 		 320 aa  168  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  39.83 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  39.51 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  40.25 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.7 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  39 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  36.89 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  40.66 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  40.66 
 
 		 270 aa  165  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2398  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.44 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.670056 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.8 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.8 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  35.66 
 
 		 323 aa  163  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.82 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  38.68 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  42.04 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03790  rRNA methylase, putative, group 3  34.66 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000601463  normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.27 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  37.55 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  33.6 
 
 		 249 aa  161  7e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.24 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  42.93 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.5 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31979  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.48 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  34.57 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.7 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  39.51 
 
 		 314 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.16 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  45.37 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.18 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.5 
 
 		 326 aa  158  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.43 
 
 		 327 aa  158  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.51 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  38.4 
 
 		 312 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  40.76 
 
 		 314 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  37.34 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.39 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0753  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.48 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205206  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  39.09 
 
 		 314 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0781  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.92 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208015  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.4 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  37.34 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  38.66 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  36.48 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.16 
 
 		 292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.16 
 
 		 292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.93 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>