More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2043 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 
253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.53 
 
 
246 aa  231  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.83 
 
 
315 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.93 
 
 
245 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  46.22 
 
 
277 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  45.38 
 
 
247 aa  228  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  47.48 
 
 
246 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  46.44 
 
 
289 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  46.44 
 
 
289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  43.7 
 
 
243 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.28 
 
 
247 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  41.49 
 
 
244 aa  215  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.28 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  42.86 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  42.86 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  42.86 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  42.86 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.86 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  42.86 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.86 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  41.56 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  42.02 
 
 
247 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.98 
 
 
256 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.98 
 
 
256 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.59 
 
 
246 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  43.28 
 
 
248 aa  204  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  40.33 
 
 
245 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.6 
 
 
246 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.15 
 
 
256 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.6 
 
 
246 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.44 
 
 
261 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  43.1 
 
 
248 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.18 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.33 
 
 
249 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.08 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.18 
 
 
255 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  39.5 
 
 
245 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.41 
 
 
246 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  41.25 
 
 
242 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.49 
 
 
248 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  40.34 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  39.32 
 
 
251 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  39.34 
 
 
248 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  39.34 
 
 
248 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  39.08 
 
 
249 aa  186  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.51 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  38.66 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  37.66 
 
 
323 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  37.55 
 
 
314 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.15 
 
 
310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.91 
 
 
237 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.76 
 
 
264 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  39.06 
 
 
238 aa  178  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.09 
 
 
250 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.09 
 
 
324 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.82 
 
 
327 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.43 
 
 
292 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.43 
 
 
292 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  37.66 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  37.13 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.83 
 
 
327 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  35.27 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1346  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.9 
 
 
331 aa  172  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  36.84 
 
 
252 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  38.28 
 
 
330 aa  171  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  35.66 
 
 
251 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.96 
 
 
251 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  34.98 
 
 
255 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  38.91 
 
 
234 aa  169  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.28 
 
 
246 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  37.27 
 
 
248 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  39.43 
 
 
242 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  39.43 
 
 
242 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  37.83 
 
 
233 aa  167  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  36.4 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4924  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.43 
 
 
326 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2119  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.49 
 
 
519 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.31 
 
 
387 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0672  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.5 
 
 
333 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.927716  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  35.92 
 
 
322 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.73 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000179001  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  33.19 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.42 
 
 
326 aa  165  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  36.16 
 
 
245 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  34.15 
 
 
246 aa  164  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  36.82 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.75 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.49 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.03 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.06 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.87 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  35.56 
 
 
251 aa  162  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  35.59 
 
 
312 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.33 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  35.66 
 
 
320 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.17 
 
 
234 aa  161  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  36.73 
 
 
250 aa  161  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0359  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.1 
 
 
321 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.51 
 
 
252 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.29 
 
 
247 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>