More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0348 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  68.1 
 
 
234 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.84 
 
 
315 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  40.51 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  40.51 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.82 
 
 
246 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  42.98 
 
 
247 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  37.55 
 
 
248 aa  168  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.55 
 
 
245 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.71 
 
 
249 aa  165  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.13 
 
 
248 aa  165  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  35.15 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.49 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  35.56 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.13 
 
 
239 aa  162  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  38.89 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  38.89 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  36.67 
 
 
244 aa  161  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.86 
 
 
246 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  36.97 
 
 
242 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  36.6 
 
 
247 aa  158  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.6 
 
 
247 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  36.6 
 
 
247 aa  158  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  36.6 
 
 
247 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  36.6 
 
 
247 aa  158  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  36.6 
 
 
247 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  36.67 
 
 
277 aa  158  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  36.6 
 
 
247 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.6 
 
 
247 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.6 
 
 
247 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.6 
 
 
247 aa  157  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.83 
 
 
261 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  37.18 
 
 
249 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.77 
 
 
255 aa  155  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  35.32 
 
 
247 aa  154  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  37.85 
 
 
258 aa  153  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.29 
 
 
246 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.87 
 
 
237 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.76 
 
 
250 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.83 
 
 
247 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.81 
 
 
256 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31979  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  35.19 
 
 
249 aa  149  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  33.47 
 
 
248 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.32 
 
 
246 aa  148  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.98 
 
 
250 aa  148  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.32 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.91 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  33.76 
 
 
242 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  32.49 
 
 
247 aa  143  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  36.12 
 
 
238 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  33.74 
 
 
245 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  34.32 
 
 
251 aa  142  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  30.93 
 
 
248 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  30.93 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.52 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  30.93 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.61 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  34.45 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  30.93 
 
 
248 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.52 
 
 
256 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.93 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.54 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.67 
 
 
321 aa  138  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.51 
 
 
251 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.76 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1080  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.75 
 
 
193 aa  137  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.211131  hitchhiker  0.000000773315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  34.04 
 
 
323 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  31.93 
 
 
250 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0728  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.86 
 
 
244 aa  137  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  35.11 
 
 
233 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  33.19 
 
 
251 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.11 
 
 
256 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  32.63 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  39.09 
 
 
238 aa  135  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  32.37 
 
 
248 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.2 
 
 
254 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.77 
 
 
327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.06 
 
 
251 aa  134  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  46.98 
 
 
240 aa  134  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.78 
 
 
310 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  30.71 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  33.19 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  32 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  33.91 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  34.91 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  33.47 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  35.12 
 
 
248 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.96 
 
 
316 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  30.42 
 
 
372 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  29.29 
 
 
314 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  38.73 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.51 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3629  RNA methyltransferase  31.22 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0470316  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  33.33 
 
 
320 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.68 
 
 
264 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  30 
 
 
373 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0230  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.48 
 
 
237 aa  131  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0753  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.62 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205206  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  30.13 
 
 
314 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  36.6 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>