More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0116 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  100 
 
 
238 aa  476  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0230  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  72.77 
 
 
237 aa  361  7.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  56.28 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  39.75 
 
 
244 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  41.63 
 
 
247 aa  190  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.5 
 
 
245 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  40.77 
 
 
247 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  40.77 
 
 
247 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  40.77 
 
 
247 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  40.77 
 
 
247 aa  187  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.77 
 
 
247 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  40.77 
 
 
247 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.77 
 
 
247 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.34 
 
 
247 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.77 
 
 
247 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.67 
 
 
246 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.57 
 
 
256 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.98 
 
 
256 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  41.63 
 
 
277 aa  184  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.57 
 
 
256 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  41.2 
 
 
247 aa  184  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  41.91 
 
 
245 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.85 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.64 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.26 
 
 
315 aa  180  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  36.51 
 
 
247 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.06 
 
 
253 aa  178  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40 
 
 
310 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  40.83 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.8 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.84 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.98 
 
 
306 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  42.19 
 
 
246 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.42 
 
 
326 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  41.91 
 
 
314 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40 
 
 
261 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  43.04 
 
 
323 aa  169  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  43.57 
 
 
314 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  42.8 
 
 
248 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.98 
 
 
322 aa  168  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.37 
 
 
248 aa  168  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  37.22 
 
 
330 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.57 
 
 
250 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  41.77 
 
 
312 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.41 
 
 
247 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  38.3 
 
 
288 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.56 
 
 
327 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  40.26 
 
 
245 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0768  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  41.77 
 
 
244 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  42.39 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  35.56 
 
 
240 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  40.59 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  42.39 
 
 
320 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3644  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.68 
 
 
246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0690  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.68 
 
 
246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3790  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.68 
 
 
246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.57 
 
 
327 aa  164  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  39.67 
 
 
314 aa  164  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  41.45 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.7 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0359  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.91 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  40.43 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.87 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.71 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0439  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.08 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000546108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.87 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  41.8 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  37.87 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0887  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.41 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40 
 
 
316 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  35.04 
 
 
289 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.3 
 
 
246 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3629  RNA methyltransferase  42.08 
 
 
252 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0470316  normal  0.108479 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  35.04 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0789  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.08 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.22 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1346  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.89 
 
 
331 aa  162  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  40.33 
 
 
248 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3444  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.66 
 
 
243 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.882432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0856  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.16 
 
 
329 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  41.12 
 
 
246 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  40.6 
 
 
251 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4766  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.4 
 
 
243 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3601  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.24 
 
 
243 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.97 
 
 
243 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.48 
 
 
246 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.97 
 
 
243 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.97 
 
 
243 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.97 
 
 
243 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  40.08 
 
 
248 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.25 
 
 
248 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  40.33 
 
 
248 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4711  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.66 
 
 
243 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04047  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  37.97 
 
 
243 aa  158  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.97 
 
 
243 aa  158  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4740  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.97 
 
 
243 aa  158  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4651  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.97 
 
 
243 aa  158  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.326823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5696  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.97 
 
 
243 aa  158  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4424  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.97 
 
 
243 aa  158  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04009  hypothetical protein  37.97 
 
 
243 aa  158  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>