More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3458 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  100 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  87.5 
 
 		 248 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  70.37 
 
 		 252 aa  322  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  61.63 
 
 		 246 aa  318  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.04 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.08 
 
 		 315 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.98 
 
 		 245 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.56 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.08 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  40.41 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  41.63 
 
 		 247 aa  205  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  43.67 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.86 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  43.21 
 
 		 277 aa  201  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  47.39 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.59 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  39.18 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  39.18 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  39.18 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  39.18 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  39.18 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.18 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.18 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.18 
 
 		 247 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.39 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  39.18 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  40.65 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  37.45 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  37.04 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.9 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  45.38 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.21 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  42.8 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  42.98 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  40 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  36.4 
 
 		 244 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  41.32 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19440  rRNA methylase, putative, group 3  39.51 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129696 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.84 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.6 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.75 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  40.5 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  35.39 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.8 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.45 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.4 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  34.78 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.63 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.98 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.69 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.34 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  39.09 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.24 
 
 		 316 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  43.27 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.65 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.46 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2398  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.84 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.670056 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.31 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.27 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  42.51 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  40.5 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  40.5 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  38.21 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0753  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.68 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205206  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.39 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  39.59 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.04 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  39.18 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  38.24 
 
 		 312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.56 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.28 
 
 		 363 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  38.39 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  39.18 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  40.33 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 323 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0581  RNA methyltransferase  43.03 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61599  hitchhiker  0.0000000000000171085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.45 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.25 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.97 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31979  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  39.18 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.57 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.68 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0781  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.74 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208015  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.96 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  37.14 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  41.25 
 
 		 314 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03790  rRNA methylase, putative, group 3  33.47 
 
 		 300 aa  158  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000601463  normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.04 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  45.63 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  36.73 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0685  rRNA methyltranferase  41.15 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.04 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  36.48 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.13 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  36.63 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  35.66 
 
 		 251 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>