More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1084 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  100 
 
 
242 aa  488  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  100 
 
 
242 aa  488  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  48.95 
 
 
240 aa  236  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  47.92 
 
 
234 aa  229  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  49.15 
 
 
238 aa  222  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  44.17 
 
 
245 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.58 
 
 
256 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.17 
 
 
256 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.75 
 
 
256 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  44.17 
 
 
248 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  39.92 
 
 
247 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  40.66 
 
 
244 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.95 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.34 
 
 
248 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.75 
 
 
256 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.24 
 
 
246 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  41.08 
 
 
242 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  41.88 
 
 
249 aa  185  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  41.25 
 
 
243 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.29 
 
 
250 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.66 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.67 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  42.62 
 
 
289 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  40.17 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.85 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  42.21 
 
 
289 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.33 
 
 
250 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.66 
 
 
237 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.92 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.92 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  39.92 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  39.11 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  39.11 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  39.52 
 
 
247 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.97 
 
 
255 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.43 
 
 
253 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  39.68 
 
 
247 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.68 
 
 
245 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.49 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.29 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1080  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.9 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.211131  hitchhiker  0.000000773315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  38.62 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  42.51 
 
 
263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  45.1 
 
 
254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.59 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  40.16 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  38.52 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  38.27 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1270  RNA methyltransferase  41.56 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.907902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.03 
 
 
247 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.52 
 
 
250 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  36.1 
 
 
251 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  41.06 
 
 
240 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  46.67 
 
 
248 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3601  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  41.46 
 
 
243 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  41.58 
 
 
247 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0789  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.87 
 
 
244 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.91 
 
 
246 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.83 
 
 
246 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.4 
 
 
246 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3444  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40.98 
 
 
243 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.882432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1903  RNA methyltransferase  43.35 
 
 
244 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0247051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.34 
 
 
247 aa  168  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.11 
 
 
251 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  46.11 
 
 
248 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1489  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.25 
 
 
244 aa  168  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.91 
 
 
246 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.5 
 
 
247 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  45.56 
 
 
248 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  46.11 
 
 
248 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.51 
 
 
248 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3414  RNA methyltransferase  37.82 
 
 
248 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.377337  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.48 
 
 
246 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.48 
 
 
246 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.67 
 
 
247 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  42.31 
 
 
245 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.48 
 
 
246 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
277 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.49 
 
 
246 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.67 
 
 
247 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  38.84 
 
 
248 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.86 
 
 
324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  42.58 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  37.24 
 
 
247 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.24 
 
 
247 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  37.24 
 
 
247 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  37.24 
 
 
247 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  37.24 
 
 
247 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.24 
 
 
247 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  37.24 
 
 
247 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  40 
 
 
247 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.48 
 
 
246 aa  165  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  35 
 
 
246 aa  165  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>