More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2119 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2119  RNA methyltransferase TrmH, group 3  100 
 
 
519 aa  1004    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  66.93 
 
 
327 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  66.8 
 
 
292 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  66.8 
 
 
292 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  62.68 
 
 
323 aa  342  8e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  62.07 
 
 
310 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  56.05 
 
 
387 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  59.92 
 
 
288 aa  308  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  48.39 
 
 
652 aa  295  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.03 
 
 
542 aa  294  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.89 
 
 
442 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.41 
 
 
416 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.86 
 
 
413 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  47.03 
 
 
536 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  52.12 
 
 
349 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.29 
 
 
336 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.19 
 
 
334 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.88 
 
 
335 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  41.57 
 
 
289 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  41.57 
 
 
289 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.2 
 
 
255 aa  220  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.64 
 
 
245 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  44.49 
 
 
277 aa  217  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.62 
 
 
315 aa  216  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.49 
 
 
247 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  45.49 
 
 
247 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  45.49 
 
 
247 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  45.49 
 
 
247 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  45.49 
 
 
247 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  48.4 
 
 
242 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.49 
 
 
247 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  45.49 
 
 
247 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.49 
 
 
247 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.49 
 
 
247 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  45.49 
 
 
247 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.52 
 
 
326 aa  209  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.04 
 
 
246 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.44 
 
 
249 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.09 
 
 
327 aa  207  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  43.85 
 
 
247 aa  207  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  45.04 
 
 
256 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0672  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.6 
 
 
333 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.927716  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.22 
 
 
248 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.08 
 
 
246 aa  200  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  40.57 
 
 
247 aa  200  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  46.34 
 
 
250 aa  200  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  43.39 
 
 
243 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  45.64 
 
 
245 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.49 
 
 
322 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  44.26 
 
 
322 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  42.8 
 
 
314 aa  194  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  44.72 
 
 
245 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.46 
 
 
321 aa  193  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  47.77 
 
 
246 aa  193  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31740  rRNA methylase, putative, group 3  45.53 
 
 
339 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.29916  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0363  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.11 
 
 
244 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.6 
 
 
248 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.15 
 
 
246 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04047  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  42.45 
 
 
243 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.45 
 
 
243 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4651  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.45 
 
 
243 aa  191  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.326823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04009  hypothetical protein  42.45 
 
 
243 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3833  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.45 
 
 
243 aa  191  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000869352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4740  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.45 
 
 
243 aa  191  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4424  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.45 
 
 
243 aa  191  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5696  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.45 
 
 
243 aa  191  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  43.44 
 
 
323 aa  190  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  43.51 
 
 
251 aa  190  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4711  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  43.09 
 
 
243 aa  189  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  43.51 
 
 
248 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4766  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.45 
 
 
243 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  49.05 
 
 
256 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  45.87 
 
 
246 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  40.83 
 
 
249 aa  188  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.45 
 
 
243 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.45 
 
 
243 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.45 
 
 
243 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  42.45 
 
 
243 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  39.44 
 
 
251 aa  187  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.27 
 
 
254 aa  187  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  39.51 
 
 
249 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.18 
 
 
324 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.4 
 
 
256 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.81 
 
 
256 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  44.08 
 
 
320 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  40 
 
 
247 aa  184  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0856  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.13 
 
 
329 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  39.83 
 
 
249 aa  183  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  39.83 
 
 
248 aa  183  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  39.83 
 
 
248 aa  183  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0731  RNA methyltransferase  40.32 
 
 
328 aa  183  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  42.8 
 
 
245 aa  183  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  42.29 
 
 
248 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.17 
 
 
247 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  42.69 
 
 
248 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  41.34 
 
 
372 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  41.56 
 
 
314 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.17 
 
 
253 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  41.11 
 
 
255 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  40.32 
 
 
249 aa  181  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>