More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  100 
 
 		 312 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0359  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  72.64 
 
 		 321 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  62.46 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4924  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  65.05 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  64.72 
 
 		 314 aa  371  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  64.17 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  61.06 
 
 		 324 aa  358  6e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158472  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4736  RNA methyltransferase TrmH, group 3  65.91 
 
 		 314 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4822  RNA methyltransferase  65.91 
 
 		 314 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945978  normal  0.837173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5122  RNA methyltransferase  65.91 
 
 		 314 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696919  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13612  tRNA/rRNA methyltransferase  62.71 
 
 		 322 aa  353  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.288349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  59.68 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  56.78 
 
 		 327 aa  342  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  58.36 
 
 		 314 aa  329  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0655  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  60.48 
 
 		 319 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.229838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  57.33 
 
 		 322 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0781  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  57.78 
 
 		 324 aa  328  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208015  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0672  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  56.52 
 
 		 333 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.927716  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  53.02 
 
 		 372 aa  328  9e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  54.87 
 
 		 322 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  52.07 
 
 		 373 aa  322  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  52.29 
 
 		 326 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8152  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  56.19 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0372  RNA methyltransferase  51.14 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176167  hitchhiker  0.00238073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  55.7 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0856  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  51.74 
 
 		 329 aa  316  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31740  rRNA methylase, putative, group 3  52.6 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.29916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0731  RNA methyltransferase  51.27 
 
 		 328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  53.58 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  54.17 
 
 		 363 aa  309  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  53.99 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  51.79 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0353  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  54.85 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  53.18 
 
 		 306 aa  291  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03800  rRNA methylase, putative, group 3  50.99 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.395862  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1346  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.6 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762958 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  45.99 
 
 		 330 aa  268  8e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  52.07 
 
 		 250 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.84 
 
 		 245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  41.37 
 
 		 247 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  40.56 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.16 
 
 		 247 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.76 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  39.76 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  39.76 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  39.76 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  39.76 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.08 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.76 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  39.76 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  42.8 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  35.77 
 
 		 247 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.96 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.7 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.53 
 
 		 327 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  35.04 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  40.8 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.62 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  34.67 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.32 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.8 
 
 		 250 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  41.32 
 
 		 245 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.15 
 
 		 542 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.98 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  37.6 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  34.88 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1304  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.03 
 
 		 652 aa  176  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.8 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.83 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.94 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.98 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.94 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.4 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.56 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  36.44 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  36.44 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.63 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.32 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  42.98 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  43.44 
 
 		 536 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  38.11 
 
 		 246 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.5 
 
 		 246 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.19 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.43 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0116  RNA methyltransferase TrmH family, group 3  41.56 
 
 		 238 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328344  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  42.15 
 
 		 245 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.21 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.96 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  36.36 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  40.33 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  37.14 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.45 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.54 
 
 		 416 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.15 
 
 		 246 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0230  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.53 
 
 		 237 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  38.68 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  37.9 
 
 		 251 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.53 
 
 		 254 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.1 
 
 		 387 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>