More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1474 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 		 239 aa  475  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  42.26 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.49 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.95 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.46 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.08 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  40.17 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  38.49 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  39.75 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  39.75 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.74 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  39.74 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  39.74 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.74 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  39.74 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.74 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.93 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.32 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.08 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.66 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  45.96 
 
 		 251 aa  184  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.08 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  39.83 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  39.83 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.26 
 
 		 327 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  38.66 
 
 		 247 aa  181  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  41.56 
 
 		 277 aa  181  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.17 
 
 		 326 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  38.49 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.24 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.24 
 
 		 310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.77 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.17 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  41.49 
 
 		 288 aa  176  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.6 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.83 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.6 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  37.87 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  40.51 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0912  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.75 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  37.71 
 
 		 323 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.08 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  39.08 
 
 		 248 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  38.08 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.32 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19440  rRNA methylase, putative, group 3  37.3 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0856  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.43 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  35.8 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  36.33 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.03 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  37.13 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  36.71 
 
 		 372 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  36.29 
 
 		 373 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2398  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.45 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.670056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0731  RNA methyltransferase  39.84 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.3 
 
 		 306 aa  168  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0781  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.17 
 
 		 324 aa  168  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208015  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0372  RNA methyltransferase  36.67 
 
 		 386 aa  168  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176167  hitchhiker  0.00238073 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.83 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  39.08 
 
 		 322 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  36.86 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1473  rRNA methylase  35.71 
 
 		 330 aa  166  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  36.02 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.71 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.27 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  37.71 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  36.67 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.17 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  36.97 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.07 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.44 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.13 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  35.22 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  38.4 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1346  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.41 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.66 
 
 		 324 aa  161  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  36.48 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  37.13 
 
 		 248 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  37.13 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  35.83 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0672  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.02 
 
 		 333 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.927716  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.49 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31740  rRNA methylase, putative, group 3  37.92 
 
 		 339 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.29916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4924  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.68 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  37.13 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03790  rRNA methylase, putative, group 3  34.4 
 
 		 300 aa  159  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000601463  normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  34.98 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.57 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  37.13 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.63 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  36.13 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  35.98 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13612  tRNA/rRNA methyltransferase  35.59 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.288349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  35.98 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.56 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>