More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1692 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 
256 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31979  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.21 
 
 
246 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  40 
 
 
244 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.68 
 
 
327 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.64 
 
 
255 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  47.7 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2629  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.74 
 
 
387 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.08 
 
 
249 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  40.73 
 
 
323 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.32 
 
 
248 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.32 
 
 
245 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.8 
 
 
246 aa  175  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  43.33 
 
 
242 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  42.32 
 
 
243 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.31 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  36.33 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  39.33 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  38.15 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.31 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  38.15 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  38.15 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  38.15 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.59 
 
 
310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  38.15 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.15 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.15 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.8 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.46 
 
 
315 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  35.27 
 
 
289 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  35.27 
 
 
289 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  43.27 
 
 
245 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  42.26 
 
 
251 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  37.5 
 
 
247 aa  168  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  46.15 
 
 
237 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  35 
 
 
288 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3084  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.54 
 
 
234 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.15 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  45.08 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  37.96 
 
 
248 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.8 
 
 
292 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.8 
 
 
292 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.84 
 
 
246 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.74 
 
 
246 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.62 
 
 
256 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.36 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  41.15 
 
 
245 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.03 
 
 
256 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.62 
 
 
256 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  37.3 
 
 
277 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  32.63 
 
 
240 aa  158  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  38.56 
 
 
238 aa  158  9e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2119  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.72 
 
 
519 aa  155  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383182 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  34.3 
 
 
248 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  34.3 
 
 
248 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  37.96 
 
 
246 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  35.66 
 
 
249 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0262  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.8 
 
 
416 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.8 
 
 
442 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0566162 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  38.3 
 
 
234 aa  151  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  41.24 
 
 
251 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.87 
 
 
264 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.45 
 
 
261 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  42.97 
 
 
252 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1155  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.66 
 
 
542 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.623752  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0348  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.81 
 
 
232 aa  150  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10311  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.17 
 
 
349 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.988579  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.53 
 
 
327 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39 
 
 
316 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  38.61 
 
 
323 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.56 
 
 
253 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06961  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.42 
 
 
413 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.1089  normal  0.124675 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  33.47 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  38.06 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  39.37 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  40.32 
 
 
314 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.04 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  34.16 
 
 
249 aa  145  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  39.34 
 
 
247 aa  145  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.13 
 
 
250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.84 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.61 
 
 
239 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  35.59 
 
 
242 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.71 
 
 
254 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  35.59 
 
 
242 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  37.36 
 
 
322 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  37.92 
 
 
248 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  33.47 
 
 
242 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  44.68 
 
 
248 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.52 
 
 
250 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.33 
 
 
336 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09121  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.03 
 
 
335 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15801  rRNA methylase  38.17 
 
 
536 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  42.29 
 
 
234 aa  141  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09101  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.19 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03790  rRNA methylase, putative, group 3  40.8 
 
 
300 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000601463  normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  35.87 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.11 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.6 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.51 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  38.17 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>