45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2842 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2842  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.002241  decreased coverage  0.0000781436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2748  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  97.24 
 
 
254 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20465  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1611  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  95.67 
 
 
249 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050624  normal  0.825884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2447  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  87.4 
 
 
257 aa  447  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000932167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2765  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  86.06 
 
 
241 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000737812  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1473  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  79.44 
 
 
202 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.253583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1485  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  79.44 
 
 
202 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1420  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  79.44 
 
 
202 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134713  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3075  RNA methyltransferase  77.78 
 
 
203 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  74.44 
 
 
200 aa  270  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.145291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2663  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  73.71 
 
 
180 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.299064  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3013  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  72.25 
 
 
177 aa  255  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0108117  normal  0.339909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1642  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  68.33 
 
 
177 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00428557  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2584  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  70.06 
 
 
174 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2412  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  65.36 
 
 
174 aa  237  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294882  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1568  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000175269 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3418  hypothetical protein  58.1 
 
 
177 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0544122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2719  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.4 
 
 
175 aa  211  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.159423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4113  RNA methyltransferase  55.32 
 
 
194 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0754  rRNA methylase (SpoU_methylase)  57.71 
 
 
171 aa  205  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01885  putative cold-shock RNA methyltransferase  55.81 
 
 
182 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07014  23S rRNA methyltransferase  51.98 
 
 
175 aa  184  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0567  putative rRNA methylase  52.81 
 
 
170 aa  184  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.96226  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2233  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.87 
 
 
198 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.237391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1287  putative RNA methyltransferase  58.45 
 
 
152 aa  175  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1395  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.34 
 
 
178 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.502759  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3916  hypothetical protein  50.31 
 
 
165 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.919251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1569  hypothetical protein  50.62 
 
 
166 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00445287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1304  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.52 
 
 
156 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4108  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.82 
 
 
156 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4585  RNA methyltransferase  52.11 
 
 
156 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3116  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.35 
 
 
164 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2330  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.95 
 
 
162 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18358  hitchhiker  0.00000314878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3894  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.78 
 
 
133 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3896  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.28 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01575  hypothetical protein  27.46 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3372  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.5 
 
 
203 aa  62.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88222  predicted protein  26.71 
 
 
311 aa  56.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0289002 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  23.16 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.89 
 
 
326 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21660  rRNA methylase  30.6 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4596  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  21.74 
 
 
165 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  23.12 
 
 
250 aa  42  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05145  putative SpoU rRNA methylase family protein  24.55 
 
 
178 aa  42  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>