More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1304 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1304  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
223 aa  430  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357101  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1853  RNA methyltransferase  34.84 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  32.8 
 
 
267 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2397  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.55 
 
 
266 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.004624  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2141  RNA methyltransferase  39.33 
 
 
257 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1207  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.07 
 
 
270 aa  132  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0784669  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.12 
 
 
267 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000197241  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1437  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3618  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.43 
 
 
245 aa  118  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1341  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.44 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.240976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3250  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.19 
 
 
254 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1093  23S rRNA methyltransferase  30.2 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000062165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0566  RNA methyltransferase, TrmH family  33.19 
 
 
265 aa  111  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000331759  hitchhiker  0.0000000100751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4688  RNA methyltransferase  33.19 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000546426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4305  23S rRNA methyltransferase  33.61 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0650881  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1923  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.43 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0334  rRNA methylase  30.13 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.693845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1819  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.14 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.175485  normal  0.555192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4393  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.19 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000250925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4688  RNA methyltransferase, TrmH family  33.19 
 
 
254 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000539995  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2125  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
267 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5040  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.89 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4457  RNA methyltransferase  32.49 
 
 
254 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0808  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.37 
 
 
251 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4805  RNA methyltransferase  32.49 
 
 
254 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00212295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4676  RNA methyltransferase, TrmH family  32.77 
 
 
265 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90567e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4673  RNA methyltransferase, TrmH family  32.77 
 
 
265 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4295  23S rRNA methyltransferase  32.77 
 
 
254 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2650  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
254 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00276989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.51 
 
 
256 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0173286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2169  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.33 
 
 
261 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000507695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0417  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.67 
 
 
264 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1436  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.2 
 
 
260 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0303105  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0025  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.81 
 
 
286 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152428 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1735  SpoU rRNA methylase family protein  34.13 
 
 
265 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1268  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.3 
 
 
249 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0294  rRNA methyltransferase  32.92 
 
 
245 aa  102  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000126477  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  30.86 
 
 
274 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.24 
 
 
268 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0955758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2613  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.25 
 
 
285 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1675  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.23 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0744  RNA methyltransferase  33.73 
 
 
254 aa  99  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1753  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.31 
 
 
272 aa  99  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0368079  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1465  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.42 
 
 
242 aa  99  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4637  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.06 
 
 
262 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0580801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5480  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.8 
 
 
272 aa  98.6  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666691  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0296  SpoU rRNA methylase family protein  34.82 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172027 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0720  RNA methyltransferase  27.66 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0623  rRNA methylase  30.42 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0464  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.86 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.57 
 
 
327 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1394  rRNA methylase  29.46 
 
 
253 aa  96.3  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  hitchhiker  1.76373e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1311  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.87 
 
 
269 aa  95.9  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.662329  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  32.98 
 
 
323 aa  95.5  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.55 
 
 
272 aa  95.5  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000452495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3173  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.39 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0121288  normal  0.209756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2462  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.19 
 
 
237 aa  95.5  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.94 
 
 
286 aa  95.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.46 
 
 
271 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299971  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.72 
 
 
260 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3145  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.72 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00100034  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3055  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.31 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2063  putative rRNA methylase  34.52 
 
 
275 aa  94.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00825348  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1196  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.66 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1218  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.66 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2142  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.14 
 
 
289 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00455486  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1606  RNA methyltransferase  34.29 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0012787  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0150  RNA methyltransferase  33.2 
 
 
297 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0145  RNA methyltransferase  33.2 
 
 
297 aa  92.8  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2090  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.1 
 
 
263 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3094  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.54 
 
 
262 aa  91.7  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.922753  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.88 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0162  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.01 
 
 
294 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1870  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.13 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1800  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.2 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0915  rRNA methylase  28.09 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00701819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1035  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.64 
 
 
262 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1107  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.06 
 
 
260 aa  89.4  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.3 
 
 
286 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1516  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.06 
 
 
262 aa  89.4  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12258  putative tRNA/rRNA methyltransferase  31.89 
 
 
244 aa  89  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4499  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  31.4 
 
 
270 aa  89  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.266243  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0053  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.75 
 
 
286 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.87191  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1199  tRNA/rRNA methyltransferase  32.47 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354486  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2051  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.43 
 
 
254 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1878  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.17 
 
 
296 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1483  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.11 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016152 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0462  RNA methyltransferase  23.53 
 
 
255 aa  87  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2492  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.14 
 
 
269 aa  87  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.42 
 
 
270 aa  86.3  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.5 
 
 
324 aa  86.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.36 
 
 
306 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3229  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.27 
 
 
247 aa  86.3  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0330  RNA methyltransferase  30.68 
 
 
257 aa  85.5  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1016  RNA methyltransferase  32.93 
 
 
234 aa  85.5  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1757  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.25 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0561  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.32 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0570  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.35 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01509  hypothetical protein  29.32 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.75 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>