More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0364 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0364  RNA methyltransferase  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0637729  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl374  rRNA methyltransferase  62.86 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000924245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  43.51 
 
 		 162 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0264  RNA methyltransferase, TrmH family  46.43 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.194384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.67 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  41.67 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  41.67 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  41.67 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  41.67 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.67 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.67 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  41.67 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.67 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.94 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  41.03 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  38.22 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf364  SpoU class tRNA/rRNA methyltransferase  39.77 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000276139  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  42.48 
 
 		 156 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  42.48 
 
 		 156 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.74 
 
 		 157 aa  131  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  39.87 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38.31 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.41 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  38.06 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  38.06 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  39.74 
 
 		 149 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  39.74 
 
 		 149 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  38.85 
 
 		 164 aa  121  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38.96 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  37.58 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1629  tRNA/rRNA methyltransferase  40.26 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  38.96 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.54 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.48 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1346  rRNA methylase (SpoU class)  34.86 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  36.13 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.18 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.431138  normal  0.429518 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.19 
 
 		 152 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  37.18 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.5 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.5 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.18 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.5 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  37.5 
 
 		 157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.5 
 
 		 157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  37.66 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.5 
 
 		 157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.09 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1472  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.66 
 
 		 156 aa  111  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0119863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  36.54 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.58 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  36.54 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  36.54 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  36.84 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  36.53 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1155  rRNA methylase (SpoU class)  35.71 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  36.84 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0129  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  35.26 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  35.71 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  36.18 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  36.18 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0658  rRNA methylase (SpoU class)  34.19 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  36.42 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  36.42 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.54 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  35.76 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  35.76 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  37.42 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  35.53 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  35.76 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  34.73 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1241  RNA methyltransferase TrmH, group 2  33.97 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  35.76 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1528  RNA methyltransferase  38.1 
 
 		 152 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  35.76 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  35.76 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0874  RNA methyltransferase  34.21 
 
 		 159 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  35.76 
 
 		 154 aa  104  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1222  tRNA/rRNA methyltransferase  35.19 
 
 		 186 aa  103  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181503  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  32.74 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.41 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121067  normal  0.063625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  32.74 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  37.16 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  34.16 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.91 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  34.19 
 
 		 154 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0359  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.55 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  35.1 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  36.91 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  35.03 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  35.03 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1170  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.57 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000414692  hitchhiker  0.000503269 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  35.03 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.37 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  35.48 
 
 		 151 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.44 
 
 		 153 aa  101  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4175  RNA methyltransferase TrmH, group 2  33.77 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.95 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>