More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1605 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 153 aa  317  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.23 
 
 		 172 aa  211  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  64.86 
 
 		 166 aa  200  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  61.49 
 
 		 162 aa  190  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  58.78 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.33 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  58.78 
 
 		 152 aa  181  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.05 
 
 		 154 aa  173  9e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.36 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  54.05 
 
 		 155 aa  171  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.56 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  52.56 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  52.56 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  52.56 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  52.56 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.56 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  52.56 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.56 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.56 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  52.56 
 
 		 162 aa  170  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  52.29 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  52.05 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  52.03 
 
 		 152 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.7 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  51.92 
 
 		 162 aa  167  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.79 
 
 		 157 aa  167  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  53.38 
 
 		 152 aa  166  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.05 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.03 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  53.95 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1097  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.74 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.116876  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1248  RNA methyltransferase  51.35 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.67 
 
 		 152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0040  RNA methyltransferase  53.38 
 
 		 159 aa  159  9e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.97 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.66 
 
 		 157 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  51.01 
 
 		 153 aa  156  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0983  RNA methyltransferase  49.66 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553899  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0913  RNA methyltransferase  49.66 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0421038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  47.3 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  51.01 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0597  rRNA methylase, SpoU family  50 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000064162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.28 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0908  RNA methyltransferase  48.99 
 
 		 155 aa  154  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.002208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.68 
 
 		 148 aa  153  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1452  putative rRNA methylase  47.62 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000390375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.97 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1511  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.3 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000118005  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  49.33 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.95 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.95 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  46 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  48.67 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  49.33 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.21 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3202  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.99 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  44.59 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  48 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  48 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  45.75 
 
 		 169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  45.7 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.99 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0044  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.07 
 
 		 220 aa  141  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1528  RNA methyltransferase  47.22 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  46.67 
 
 		 161 aa  140  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.75 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.938343  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.59 
 
 		 156 aa  139  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.431138  normal  0.429518 
 
 
-
 
NC_002620  TC0827  spoU rRNA methylase family protein  47.26 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000730061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22350  predicted rRNA methylase SpoU family  46.62 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.3 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  45.64 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  46.31 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  45.64 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  49.01 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.75 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  44.97 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  44.67 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06670  predicted rRNA methylase SpoU family  46.62 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.728557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  48.68 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0450  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.26 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0658  rRNA methylase (SpoU class)  48.03 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.02 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0990  RNA methyltransferase  45.64 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411714  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1000  tRNA/rRNA methylase  41.61 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0879  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.61 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  46.31 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1155  rRNA methylase (SpoU class)  45.39 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  45.21 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.21 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.21 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  45.21 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.03 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.21 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  45.1 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1127  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.05 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  47.4 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.21 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.21 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>