More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3943 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  100 
 
 		 157 aa  327  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  100 
 
 		 157 aa  327  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  99.36 
 
 		 157 aa  326  7e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  98.73 
 
 		 157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  98.73 
 
 		 157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  98.73 
 
 		 157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  98.73 
 
 		 157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  98.09 
 
 		 157 aa  323  6e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  98.09 
 
 		 157 aa  323  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  94.23 
 
 		 157 aa  310  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  94.23 
 
 		 157 aa  310  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  93.59 
 
 		 157 aa  309  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  93.59 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  93.59 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0129  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  91.72 
 
 		 157 aa  306  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  82.17 
 
 		 157 aa  279  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  80.25 
 
 		 162 aa  275  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  80.25 
 
 		 162 aa  275  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  80.25 
 
 		 162 aa  275  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1629  tRNA/rRNA methyltransferase  74.03 
 
 		 161 aa  252  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0990  RNA methyltransferase  70.13 
 
 		 154 aa  238  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411714  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00538  putative tRNA/rRNA methyltransferase  71.9 
 
 		 154 aa  238  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3202  RNA methyltransferase TrmH, group 2  66.24 
 
 		 164 aa  230  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  64.29 
 
 		 154 aa  223  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  62.99 
 
 		 154 aa  222  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  66.01 
 
 		 177 aa  220  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00152  RNA methyltransferase  62.89 
 
 		 159 aa  219  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3301  RNA methyltransferase  66.88 
 
 		 154 aa  218  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0858286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  62.89 
 
 		 159 aa  217  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  59.74 
 
 		 154 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  61.44 
 
 		 154 aa  213  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  61.04 
 
 		 154 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  61.04 
 
 		 154 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0052  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  64.94 
 
 		 154 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  62.67 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  60.39 
 
 		 154 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  61.15 
 
 		 158 aa  210  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  60.39 
 
 		 154 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  61.44 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  60.39 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  59.09 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  60.39 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  60.39 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  60.39 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  60.39 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2539  RNA methyltransferase  61.04 
 
 		 159 aa  208  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  60.78 
 
 		 153 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  60.78 
 
 		 153 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  62.42 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  62.42 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  59.87 
 
 		 159 aa  204  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  61.44 
 
 		 153 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  59.87 
 
 		 153 aa  203  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  59.48 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  59.48 
 
 		 153 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  60.67 
 
 		 153 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  58.17 
 
 		 154 aa  200  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  58.71 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.42 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6180  RNA methyltransferase TrmH, group 2  58.71 
 
 		 156 aa  198  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  58.67 
 
 		 157 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2799  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  60.38 
 
 		 159 aa  197  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  58.82 
 
 		 154 aa  197  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  58.67 
 
 		 153 aa  197  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.92 
 
 		 159 aa  196  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2851  RNA methyltransferase  57.69 
 
 		 172 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2862  RNA methyltransferase  58.06 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4175  RNA methyltransferase TrmH, group 2  57.42 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.05 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  56.77 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  56.77 
 
 		 170 aa  193  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0233  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.05 
 
 		 156 aa  193  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0188294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  59.18 
 
 		 151 aa  193  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  58 
 
 		 151 aa  191  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3201  RNA methyltransferase  56.13 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0668  RNA methyltransferase  56.13 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1418  RNA methyltransferase  56.13 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0485  RNA methyltransferase  55.77 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0174  RNA methyltransferase  56.13 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03960  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase YibK  54.25 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2845  RNA methyltransferase  56.13 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0503  RNA methyltransferase  56.13 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  57.33 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  55.48 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  58 
 
 		 161 aa  191  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1127  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.61 
 
 		 153 aa  191  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3577  RNA methyltransferase  59.09 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  55.19 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.24 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0358  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  55.77 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1000  tRNA/rRNA methylase  55.33 
 
 		 155 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0422  RNA methyltransferase  55.48 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0874  RNA methyltransferase  55.41 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2237  RNA methyltransferase TrmH, group 2  58.11 
 
 		 168 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0879  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.33 
 
 		 155 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  56 
 
 		 152 aa  187  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.49 
 
 		 154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3185  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  58.71 
 
 		 161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4396  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.89 
 
 		 153 aa  187  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1670  RNA methyltransferase  58 
 
 		 165 aa  187  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>