More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2107 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  100 
 
 		 152 aa  314  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  61.84 
 
 		 162 aa  204  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  64.47 
 
 		 152 aa  201  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  60.93 
 
 		 164 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.74 
 
 		 152 aa  189  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.19 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  55.92 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.92 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  56.29 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.78 
 
 		 153 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.95 
 
 		 164 aa  180  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.38 
 
 		 172 aa  180  8.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.64 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.62 
 
 		 168 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  55.63 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.98 
 
 		 154 aa  168  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.95 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  50 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.63 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.35 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.35 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.35 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.35 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  49.02 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  48.37 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  49.02 
 
 		 153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  48.7 
 
 		 162 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.32 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.431138  normal  0.429518 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  50.33 
 
 		 156 aa  157  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  50.33 
 
 		 156 aa  157  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  49.67 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  50 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.86 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.68 
 
 		 160 aa  155  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  50.34 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.68 
 
 		 158 aa  153  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.34 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  47.06 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1346  rRNA methylase (SpoU class)  46.75 
 
 		 209 aa  152  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  48.08 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  50 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.74 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.62 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0450  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.34 
 
 		 152 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0658  rRNA methylase (SpoU class)  50.64 
 
 		 170 aa  148  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.52 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.97 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4396  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.99 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1452  putative rRNA methylase  50.68 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000390375  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  47.97 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0827  spoU rRNA methylase family protein  46.58 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000730061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0834  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.03 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0618819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.68 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.938343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1836  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.69 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.31 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0983  RNA methyltransferase  46.62 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553899  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0913  RNA methyltransferase  46.62 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0421038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  48.67 
 
 		 154 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0908  RNA methyltransferase  46.62 
 
 		 155 aa  140  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.002208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.67 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  48.67 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1629  tRNA/rRNA methyltransferase  47.26 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.3 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.68 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  48 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0597  rRNA methylase, SpoU family  47.97 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000064162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  48 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0310  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.37 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1511  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.58 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000118005  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.02 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1155  rRNA methylase (SpoU class)  46.1 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.68 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.68 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  46.15 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  46.15 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  46.15 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  48 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  48 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  47.33 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  48 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1248  RNA methyltransferase  44.59 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  47.68 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.36 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.36 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.68 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  48.34 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.68 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  47.68 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.1 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  44.44 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0257  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.7 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  47.33 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.66 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3910  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.34 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>