More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0990 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 172 aa  357  6e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.23 
 
 		 153 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  59.06 
 
 		 166 aa  190  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  57.05 
 
 		 153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  57.05 
 
 		 153 aa  181  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  53.38 
 
 		 152 aa  180  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.41 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1097  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.16 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.116876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.64 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  54.05 
 
 		 162 aa  171  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  52.5 
 
 		 162 aa  170  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.57 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0040  RNA methyltransferase  52.87 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.9 
 
 		 153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  49.32 
 
 		 152 aa  163  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.63 
 
 		 154 aa  163  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.97 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  50.68 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.65 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.97 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.69 
 
 		 148 aa  162  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.32 
 
 		 152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1511  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.33 
 
 		 156 aa  160  8.000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000118005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.35 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  47.33 
 
 		 154 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  49.32 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.34 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.7 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  48.68 
 
 		 169 aa  155  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  50.67 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  50.67 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  42.57 
 
 		 153 aa  154  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  48.65 
 
 		 149 aa  154  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.66 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.03 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.938343  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  47.02 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.33 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0450  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.26 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.02 
 
 		 157 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0597  rRNA methylase, SpoU family  49.66 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000064162  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  50.67 
 
 		 156 aa  150  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  45.95 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  46.9 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  45.03 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  45.03 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  45.03 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  45.03 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  45.03 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1528  RNA methyltransferase  46.53 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  45.03 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  45.03 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  45.03 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  45.03 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  45.03 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  46 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  44.97 
 
 		 151 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  50.33 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1248  RNA methyltransferase  47.26 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  44.3 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  45.03 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0983  RNA methyltransferase  47.62 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.3 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0913  RNA methyltransferase  47.62 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0421038  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1629  tRNA/rRNA methyltransferase  46.98 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1155  rRNA methylase (SpoU class)  47.37 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  43.62 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  44.37 
 
 		 153 aa  144  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  45.64 
 
 		 157 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  44.3 
 
 		 157 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  43.24 
 
 		 161 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  44.3 
 
 		 153 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  44 
 
 		 151 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  43.62 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  44.3 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0990  RNA methyltransferase  44.3 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  41.45 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  44.97 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.97 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.14 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.97 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.97 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1452  putative rRNA methylase  45.21 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000390375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.7 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  44.97 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.97 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2141  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.44 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.3 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.3 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03960  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase YibK  42.28 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0908  RNA methyltransferase  46.26 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.002208  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.3 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.3 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.75 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  40.54 
 
 		 159 aa  141  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  45.95 
 
 		 153 aa  141  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.62 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.62 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.818121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>