More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0127 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  100 
 
 
164 aa  341  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.46 
 
 
164 aa  236  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  70.7 
 
 
162 aa  229  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  62.25 
 
 
153 aa  209  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  63.06 
 
 
168 aa  204  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  60.53 
 
 
152 aa  201  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.94 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  59.6 
 
 
152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  60.93 
 
 
152 aa  194  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.65 
 
 
156 aa  191  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.55 
 
 
155 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.79 
 
 
154 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  58.33 
 
 
157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  56.41 
 
 
162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.69 
 
 
157 aa  187  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  55.77 
 
 
162 aa  185  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
162 aa  185  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
162 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
162 aa  185  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
162 aa  185  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  55.77 
 
 
162 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  55.77 
 
 
162 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  55.77 
 
 
162 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  55.77 
 
 
162 aa  185  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.78 
 
 
153 aa  185  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  55.13 
 
 
162 aa  185  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  54.84 
 
 
155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  56.46 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.63 
 
 
152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.5 
 
 
154 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.55 
 
 
154 aa  180  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.16 
 
 
158 aa  175  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  50.65 
 
 
153 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  50.65 
 
 
153 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  51.63 
 
 
169 aa  168  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.48 
 
 
158 aa  167  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.48 
 
 
158 aa  167  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  51.28 
 
 
156 aa  165  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1452  putative rRNA methylase  51.7 
 
 
156 aa  164  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000390375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.86 
 
 
157 aa  164  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.68 
 
 
172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  51.61 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.33 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.431138  normal  0.429518 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  50 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  50.32 
 
 
182 aa  159  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.37 
 
 
160 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  49.36 
 
 
156 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  49.36 
 
 
156 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
152 aa  158  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  51.27 
 
 
169 aa  156  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  50 
 
 
162 aa  153  8e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.97 
 
 
153 aa  149  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0658  rRNA methylase (SpoU class)  49.37 
 
 
170 aa  149  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  47.97 
 
 
149 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.62 
 
 
148 aa  148  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0597  rRNA methylase, SpoU family  47.97 
 
 
155 aa  148  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000064162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  47.3 
 
 
149 aa  147  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  47.65 
 
 
152 aa  147  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0827  spoU rRNA methylase family protein  48.98 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000730061  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1472  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.37 
 
 
156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0119863  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0913  RNA methyltransferase  48.99 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0421038  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0467  23S rRNA methyltransferase  46.98 
 
 
152 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0983  RNA methyltransferase  48.39 
 
 
155 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553899  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1346  rRNA methylase (SpoU class)  47.77 
 
 
209 aa  143  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48 
 
 
161 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1687  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.34 
 
 
164 aa  142  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1248  RNA methyltransferase  46.26 
 
 
161 aa  142  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1097  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.52 
 
 
156 aa  142  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.116876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.68 
 
 
154 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.8 
 
 
156 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  45.81 
 
 
154 aa  141  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0233  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.8 
 
 
156 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0188294 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1155  rRNA methylase (SpoU class)  45.45 
 
 
168 aa  140  8e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0257  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.13 
 
 
156 aa  140  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.02 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0358  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  47.71 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2862  RNA methyltransferase  46.75 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.427649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0310  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.71 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.95 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6180  RNA methyltransferase TrmH, group 2  46.75 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1943  RNA methyltransferase  49.36 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1648  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.41 
 
 
156 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.158148  normal  0.993753 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0044  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.57 
 
 
220 aa  138  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  47.06 
 
 
154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0908  RNA methyltransferase  46.31 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.002208  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.44 
 
 
157 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  45.51 
 
 
162 aa  137  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  45.51 
 
 
162 aa  137  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  45.51 
 
 
162 aa  137  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2205  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.97 
 
 
152 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.79 
 
 
157 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2268  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.97 
 
 
152 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00048141  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  46.1 
 
 
156 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.79 
 
 
157 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  46.05 
 
 
153 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.37 
 
 
159 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.79 
 
 
157 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.79 
 
 
157 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2851  RNA methyltransferase  46.1 
 
 
172 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.71 
 
 
171 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>